More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0482 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0482  NusG antitermination factor  100 
 
 
353 aa  694    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000917013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0467  NusG antitermination factor  97.17 
 
 
353 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000572665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0848  NusG antitermination factor  57.91 
 
 
354 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000981169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0641  NusG antitermination factor  54.93 
 
 
356 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000301277  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0360  NusG antitermination factor  44.48 
 
 
354 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000977619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  51.22 
 
 
176 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.22 
 
 
185 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  44.96 
 
 
175 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  47.62 
 
 
182 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.83 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  46.83 
 
 
182 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  47.58 
 
 
181 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  46.83 
 
 
182 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 
181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 
181 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  45.97 
 
 
181 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.46 
 
 
176 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  46.77 
 
 
181 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  45.97 
 
 
181 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  45.31 
 
 
185 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  46.77 
 
 
177 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  45.97 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  45.97 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  46.09 
 
 
181 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  42.38 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  43.75 
 
 
177 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  41.5 
 
 
179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  37.36 
 
 
181 aa  111  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  44.35 
 
 
181 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.4 
 
 
181 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  39.84 
 
 
175 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  45.97 
 
 
177 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  44.26 
 
 
175 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  42.19 
 
 
203 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  42.97 
 
 
175 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  44.35 
 
 
185 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  45.31 
 
 
174 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  44.09 
 
 
177 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  43.55 
 
 
180 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  40.62 
 
 
172 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 
176 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  42.86 
 
 
194 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  44.35 
 
 
179 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  45.16 
 
 
177 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  44.8 
 
 
194 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  44.8 
 
 
194 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  42.74 
 
 
183 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  41.94 
 
 
176 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  45.97 
 
 
190 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  42.74 
 
 
183 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  42.74 
 
 
183 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  45.97 
 
 
177 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 
183 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  40 
 
 
190 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  41.13 
 
 
176 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  44.35 
 
 
183 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  40.65 
 
 
175 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  43.31 
 
 
175 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  41.94 
 
 
183 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 
176 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  41.13 
 
 
176 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  45.16 
 
 
177 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 
194 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  42.74 
 
 
177 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  41.13 
 
 
185 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  41.94 
 
 
183 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  40.94 
 
 
190 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 
176 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  42.06 
 
 
177 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.94 
 
 
176 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  41.94 
 
 
183 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  42.74 
 
 
183 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  41.43 
 
 
194 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  45.31 
 
 
175 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  40.32 
 
 
176 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  36.88 
 
 
178 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  41.73 
 
 
176 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.41 
 
 
177 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  44.35 
 
 
183 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 
177 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>