More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2675 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 423 aa  851    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  70.41 
 
 		 421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  70.52 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  71.6 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  70.75 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  66.67 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  71.46 
 
 		 422 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  54.1 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  53.18 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  53.67 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  54.82 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  56.45 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.69 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  53.4 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  50.81 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  52.72 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  52.86 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  52.69 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  52.51 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  54.72 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  50.94 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  49.65 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  48.86 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  52.42 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  52.21 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  48.86 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  47.63 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  48.85 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  47.79 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  49.53 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  47.79 
 
 		 442 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  45.67 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  47.54 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  47.48 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  41.69 
 
 		 434 aa  308  8e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 		 453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  45.87 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  45.45 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  41.55 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  38.35 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  41.4 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  40.94 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  37.15 
 
 		 426 aa  242  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.75 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.66 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  37.23 
 
 		 443 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  35.46 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  35.63 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  36.15 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.17 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  37.23 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.02 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.31 
 
 		 424 aa  203  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.53 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  35.68 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.23 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  41.76 
 
 		 386 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.92 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  36.32 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  34.13 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.27 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  32.93 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  35.43 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  32.37 
 
 		 432 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  40.23 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.01 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  34.45 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  41.8 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  32.17 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  35.9 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 431 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  35.12 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  33.65 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  33.82 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.9 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.9 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.23 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.61 
 
 		 427 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 		 429 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  32.13 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  40.87 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 		 438 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  34.89 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  35.62 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>