More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3240 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 447 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  73.98 
 
 		 442 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  74.66 
 
 		 442 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  69.13 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  66.82 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  66.59 
 
 		 442 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  68.14 
 
 		 430 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  68.33 
 
 		 440 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  57.34 
 
 		 441 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  55.05 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  56.42 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  55.05 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  55.28 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  49.21 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  54.59 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  52.07 
 
 		 438 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  50 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  51.5 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  49.66 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  53.69 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  50.8 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  51.04 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  51.26 
 
 		 444 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  48.63 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  48.85 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  50.93 
 
 		 412 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  49.32 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  48.18 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  48.84 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  48.04 
 
 		 422 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  44.76 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  49.88 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  45.16 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  49.19 
 
 		 422 aa  313  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  46.56 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  44.06 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  38.52 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  38.57 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  42.05 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  39.64 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.67 
 
 		 429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  39.15 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  35.8 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  38.71 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.49 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  39.04 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  35.09 
 
 		 438 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.66 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 		 420 aa  206  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.09 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 		 441 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.39 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  33.78 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.73 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.14 
 
 		 466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.63 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  35.47 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  34.86 
 
 		 436 aa  196  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.89 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.79 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.26 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 		 437 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.1 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  38.48 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  37.25 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  35.77 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.57 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.15 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  30.95 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1331  FolC bifunctional protein  36.41 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.93 
 
 		 437 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.7 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.91 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.69 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0857  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 		 404 aa  176  8e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  38.46 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  34.87 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  40.54 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  39.25 
 
 		 386 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  30.77 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.23 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 		 451 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  39.77 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  30.54 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>