More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0024 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  100 
 
 		 470 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  73.98 
 
 		 442 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  74.21 
 
 		 442 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  66.14 
 
 		 442 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  65.91 
 
 		 442 aa  592  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  66.74 
 
 		 430 aa  591  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  69.13 
 
 		 447 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  64.25 
 
 		 440 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  52.82 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  49.21 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  52.14 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  52.14 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  51.69 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  52.37 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  48.87 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  51.92 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  51.36 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  49.08 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  48.53 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  49.2 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  49.89 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  50.34 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  48.97 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  50.23 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  48.87 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  47.63 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  47.95 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  46 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  48.29 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  46.73 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  48.36 
 
 		 412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  47.15 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  45.21 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  43.88 
 
 		 453 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  43.15 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  46.21 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  43.81 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  40.54 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  37.59 
 
 		 434 aa  261  1e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  36.53 
 
 		 435 aa  249  6e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  39.47 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  34.52 
 
 		 429 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  38.98 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.94 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  33.72 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.28 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 		 425 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  31.97 
 
 		 429 aa  200  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.8 
 
 		 431 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.43 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.46 
 
 		 438 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.28 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.15 
 
 		 424 aa  183  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  31.11 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  29.44 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  32.56 
 
 		 422 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  29.7 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  34.34 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  29.63 
 
 		 423 aa  179  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  39.64 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.25 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  32.37 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  34.34 
 
 		 435 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  30.18 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.39 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  32.59 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  30 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  29 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  33.56 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.22 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 		 434 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  33.56 
 
 		 440 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  30.31 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.61 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.49 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  29.23 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  28.5 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  33.64 
 
 		 429 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  30.89 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.66 
 
 		 421 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  33.72 
 
 		 434 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.02 
 
 		 424 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  32.95 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  29.6 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  33.26 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  34.1 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  28.7 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  32.21 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  31.65 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  32.07 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>