More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2589 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  98.82 
 
 
424 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  88.59 
 
 
412 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  100 
 
 
424 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  70.75 
 
 
423 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  69.21 
 
 
421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  69.43 
 
 
422 aa  554  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  72.88 
 
 
422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  57.74 
 
 
435 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  54.11 
 
 
441 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  55.35 
 
 
444 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  57.91 
 
 
447 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  53.88 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 
438 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  53.16 
 
 
442 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 
441 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  53.54 
 
 
442 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  51.6 
 
 
441 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  51.76 
 
 
442 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 
441 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  52.58 
 
 
448 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  50.94 
 
 
430 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  49.65 
 
 
442 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  49.42 
 
 
442 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  48.75 
 
 
470 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  50.11 
 
 
441 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  49.19 
 
 
438 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  52.22 
 
 
448 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  48.85 
 
 
447 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  49.41 
 
 
432 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  51.88 
 
 
437 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  50.35 
 
 
447 aa  359  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  51.29 
 
 
447 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  46.87 
 
 
442 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  47.56 
 
 
442 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  47.02 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  49.64 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.26 
 
 
440 aa  334  1e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  48.25 
 
 
453 aa  333  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  41.26 
 
 
429 aa  324  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  41.59 
 
 
434 aa  316  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  41.69 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  44.32 
 
 
435 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  46.56 
 
 
443 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  42.96 
 
 
467 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  40.68 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  40.28 
 
 
426 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  37.78 
 
 
422 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.58 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
441 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  34.46 
 
 
441 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  39.15 
 
 
424 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  37.5 
 
 
412 aa  216  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  32.6 
 
 
429 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.6 
 
 
424 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
428 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 
435 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 
437 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 
437 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  37.86 
 
 
448 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  41.43 
 
 
403 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.13 
 
 
425 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 
423 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  38.85 
 
 
424 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
434 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  32.63 
 
 
423 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.45 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.47 
 
 
386 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.87 
 
 
457 aa  200  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  41.1 
 
 
408 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  32.4 
 
 
423 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  39.5 
 
 
424 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  37.21 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  34.76 
 
 
422 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  32.21 
 
 
431 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
410 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  32.3 
 
 
432 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34.65 
 
 
437 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  33.33 
 
 
421 aa  193  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.07 
 
 
424 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  32.52 
 
 
428 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.51 
 
 
427 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  40 
 
 
408 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.74 
 
 
427 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  32.22 
 
 
432 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  32.22 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.42 
 
 
424 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.67 
 
 
434 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  38.82 
 
 
428 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
436 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  37.7 
 
 
437 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.82 
 
 
422 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.22 
 
 
416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  39.29 
 
 
408 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>