More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2022 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2022  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  100 
 
 		 361 aa  715    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.546679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2476  hypothetical protein  72.38 
 
 		 362 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.840509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0681  septum formation inhibitor-activating ATPase-like protein  70.44 
 
 		 355 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418052  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0769  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  69.34 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2093  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  69.34 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2771  Mrp/NBP35 family protein  67.13 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0581  putative Mrp (multidrug resistance-associated proteins) family protein  63.24 
 
 		 367 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0144462  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0395  Mrp/NBP35 family protein  58.79 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.616395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3271  hypothetical protein  57.69 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2066  MRP ATP/GTP-binding protein  46.15 
 
 		 373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0228594  normal  0.0543779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  48.19 
 
 		 375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  45.78 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.38 
 
 		 363 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  46.98 
 
 		 384 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0064  hypothetical protein  46.3 
 
 		 389 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  45.09 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1138  hypothetical protein  47.67 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  45.09 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  47.78 
 
 		 378 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3465  MinD/MRP family ATPase  45.6 
 
 		 376 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  45.51 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  57.38 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  57.38 
 
 		 358 aa  298  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  46.09 
 
 		 362 aa  298  9e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3343  hypothetical protein  48.69 
 
 		 369 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  46.93 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  47.51 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3393  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  46.39 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  44.54 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  46.25 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2187  putative multidrug-resistance related protein  45.73 
 
 		 370 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0964076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5082  MRP protein-like protein  45.68 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  43.42 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1045  hypothetical protein  46.78 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.232996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.38 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  45.53 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.66 
 
 		 362 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2410  chromosome partitioning ATPase  54.14 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2048  MRP ATP/GTP-binding protein  46.97 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1786  nucleotide-binding protein-like protein  47.38 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  45.53 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2145  MRP protein-like protein  44.99 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0923  mrp protein  48.65 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  45.07 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.82 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  44.94 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  47.5 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1066  nucleotide-binding protein-like protein  44.66 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0514785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.54 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3327  MRP-like protein (ATP/GTP-binding protein)  45.96 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0721864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2204  hypothetical protein  45.18 
 
 		 382 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.746531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.13 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  46.75 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1215  chromosome partitioning ATPase protein  45.38 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.747251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0549  protein of unknown function DUF59  44.15 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  45.51 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  45.51 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1472  chromosome partitioning ATPase protein  45.1 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.04 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  45.43 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  45.25 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  44.66 
 
 		 374 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  46.07 
 
 		 363 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  43.26 
 
 		 363 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.31 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2037  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.3 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000910104  hitchhiker  0.00000144662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.31 
 
 		 353 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0506  protein of unknown function DUF59  44.95 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.43 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.01 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.36 
 
 		 363 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.01 
 
 		 363 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  55.14 
 
 		 365 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0507  MRP-like protein  49.5 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  55.47 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.01 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.06 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.01 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  41.85 
 
 		 362 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  52.43 
 
 		 363 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  40.73 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  44.1 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  45.43 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7302  MRP protein-like protein  45.35 
 
 		 374 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  43.99 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  43.12 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  44.22 
 
 		 367 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  45.61 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  54.71 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  44.97 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2510  hypothetical protein  46.71 
 
 		 360 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.75 
 
 		 353 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  53.28 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  53.28 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  53.28 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  53.28 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  45.77 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  53.28 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  53.28 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>