More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1861 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
167 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  hitchhiker  0.00680494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0396  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617467  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0784  GNAT family acetyltransferase  44.3 
 
 
158 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  38.55 
 
 
165 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  41.86 
 
 
172 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  41.86 
 
 
172 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4892  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  46.83 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  40 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3388  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  40 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
162 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1705  phosphinothricin acetyltransferase  43.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.667334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1770  phosphinothricin acetyltransferase  43.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1570  phosphinothricin acetyltransferase  43.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.538734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1751  phosphinothricin acetyltransferase  43.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1708  phosphinothricin acetyltransferase  43.1 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0205864  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01405  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  40.35 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01416  hypothetical protein  40.35 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  40.35 
 
 
172 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  40.35 
 
 
193 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1718  acetyltransferase, GNAT family  40.35 
 
 
193 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
172 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1534  acetyltransferase  40.35 
 
 
193 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
165 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  40 
 
 
174 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5068  putative GNAT family acetyltransferase  42.4 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  40.61 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
161 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0316005  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  41.92 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  41.92 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
173 aa  108  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
171 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
175 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
175 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
226 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  37.93 
 
 
209 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  37.89 
 
 
168 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
173 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
171 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
197 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
181 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
185 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
163 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
163 aa  101  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
178 aa  100  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  36.93 
 
 
180 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  39.52 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  38.12 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0382  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
166 aa  99  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.179689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  32.3 
 
 
177 aa  97.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
178 aa  97.4  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  35.37 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  35.54 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  40 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0487  N-acetyltransferase  35.71 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  40.18 
 
 
173 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  36.87 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4837  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  41.43 
 
 
177 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
184 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  37.85 
 
 
179 aa  91.3  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
164 aa  90.9  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3154  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
198 aa  90.9  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.47 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  45.05 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09090  sortase-like acyltransferase  30.36 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.749785  normal  0.431101 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  33.54 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.59 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  35.59 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
174 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>