More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1414 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  85.11 
 
 		 244 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  79.67 
 
 		 246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  84.55 
 
 		 243 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  79.27 
 
 		 246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  79.27 
 
 		 246 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  77.91 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  63.87 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  65.52 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  63.79 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  64.5 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  60.25 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  60.26 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.61 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.7 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  60.25 
 
 		 246 aa  292  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  62.07 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  55.46 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  55.08 
 
 		 240 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  60 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  60 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  60.94 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  60.59 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  57.2 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  60.68 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  59.48 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  59.48 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  59.48 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  57.87 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  59.05 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  55.65 
 
 		 244 aa  281  9e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  59.05 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  55.7 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.69 
 
 		 245 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  58.55 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  57.02 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  58.8 
 
 		 235 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  59.21 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  59.66 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  57.26 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.21 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  61.37 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  56.6 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.94 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  55.46 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  57.63 
 
 		 255 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  58.47 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  55.33 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  56.6 
 
 		 242 aa  275  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  58.72 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.97 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  58.72 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  56.36 
 
 		 236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.55 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  56.19 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  55.46 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  55.08 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  56.19 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  57.2 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  56.17 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  57.98 
 
 		 238 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  60.91 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  58.55 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  59.07 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.24 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.7 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  55.32 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  55.08 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  54.24 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.7 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  56.58 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  52.34 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  57.56 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.72 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  55.6 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.58 
 
 		 234 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  55.27 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  54.66 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  53.88 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  58.01 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  55.6 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  55.32 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  52.34 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  54.89 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  53.19 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  54.89 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  53.19 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  55.7 
 
 		 234 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  51.93 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  53.16 
 
 		 243 aa  265  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.08 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  52.77 
 
 		 235 aa  264  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>