251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0867 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0867  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.997457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3194  ferritin Dps family protein  61.59 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1682  bacterioferritin  52.27 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2643  bacterioferritin  51.47 
 
 		 147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1380  Ferritin Dps family protein  51.16 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0127  Ferritin Dps family protein  41.73 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  35.56 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  35 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  34.81 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  34.81 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  35.56 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  34.81 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  37.04 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  37.04 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  37.04 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  36.3 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  37.78 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  35 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  34.81 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  33.33 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  32.14 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  32.59 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  37.04 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  32.86 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  35.56 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  36.3 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  36.3 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  34.81 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  33.33 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  34.81 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  34.07 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  32.59 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  33.33 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  30.37 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  30 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  32.14 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  34.07 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  32.14 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  33.33 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  31.11 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  31.11 
 
 		 159 aa  84.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  30.37 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  31.85 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  31.85 
 
 		 161 aa  83.6  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0847  rubrerythrin  37.04 
 
 		 182 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  31.85 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  30.22 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  34.07 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4125  bacterioferritin  30.71 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.648468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  28.78 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  31.11 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  34.07 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  33.33 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  31.11 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  29.63 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  31.85 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  31.62 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  29.63 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  29.63 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  31.11 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2787  bacterioferritin  28.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2757  bacterioferritin  28.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2801  bacterioferritin  28.89 
 
 		 159 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0659716  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  30.37 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  31.11 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  29.63 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  31.85 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  28.89 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  29.63 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  29.63 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  30.22 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  27.14 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  29.63 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  27.14 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  29.46 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  28.89 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  28.89 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2437  bacterioferritin  30.94 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174977  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  29.63 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  31.78 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  29.29 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  29.63 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  30.37 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>