177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2439 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  745    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  51.93 
 
 
340 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  48.41 
 
 
343 aa  346  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  41.16 
 
 
345 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  39.83 
 
 
349 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  39.83 
 
 
349 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  39.83 
 
 
349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  39.54 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  39.26 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  39.26 
 
 
349 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  39.54 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  39.54 
 
 
349 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  39.54 
 
 
349 aa  272  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  39.54 
 
 
349 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  39.26 
 
 
349 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  42.27 
 
 
343 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  42.27 
 
 
343 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  41.86 
 
 
340 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  42.86 
 
 
344 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  39.4 
 
 
342 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  36.95 
 
 
357 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  37.01 
 
 
363 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  35.21 
 
 
387 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  34.58 
 
 
396 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  34.01 
 
 
399 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  34.01 
 
 
399 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  32.94 
 
 
392 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  33.72 
 
 
394 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  34.2 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  33.62 
 
 
398 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  32.95 
 
 
371 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  32.29 
 
 
387 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  33.72 
 
 
398 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  33.72 
 
 
398 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  34.43 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  33.92 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  33.63 
 
 
394 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  33.63 
 
 
394 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  33.95 
 
 
394 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  30.18 
 
 
405 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  31.59 
 
 
397 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  32.28 
 
 
402 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  31.23 
 
 
397 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  27.76 
 
 
353 aa  149  9e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  52.38 
 
 
86 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  23.61 
 
 
346 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  23.27 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0096  peptidase M42 family protein  23.99 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  25.07 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  24.02 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  25.68 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  24.34 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  31.05 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  25.8 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0206  cellulase  27.34 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  25.49 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  21.79 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  24.28 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  25 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  28.92 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  25.95 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  30.92 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  29.17 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  30.92 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  30.92 
 
 
356 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  30.92 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  30.92 
 
 
356 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3132  hypothetical protein  24.83 
 
 
358 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  30.92 
 
 
356 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0433  glutamyl aminopeptidase  24.22 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  29.94 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  25.77 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  25.11 
 
 
362 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  24.54 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  26.17 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  26.19 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  24.21 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  24.42 
 
 
362 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  22.73 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  25.07 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  26.04 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  30.34 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  23.38 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  26.4 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0682  peptidase M42 family protein  21.18 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  25.52 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  27.27 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  25.43 
 
 
351 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3752  peptidase M42 family protein  26.76 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  25.52 
 
 
350 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  29.66 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  27.65 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  24.35 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  27.1 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  26.54 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1730  hypothetical protein  29.66 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.771203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  25 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  29.66 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1790  sgc region protein SgcX  29.66 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00171255  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1729  putative sgc region protein SgcX  29.66 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>