41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1064 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  100 
 
 
86 aa  170  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  93.02 
 
 
344 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  60.24 
 
 
340 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  53.57 
 
 
349 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  53.57 
 
 
349 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  53.57 
 
 
349 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  53.57 
 
 
349 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  53.57 
 
 
349 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  53.57 
 
 
349 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  53.57 
 
 
349 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  52.38 
 
 
349 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  52.38 
 
 
349 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  53.57 
 
 
349 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  52.38 
 
 
349 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  48.19 
 
 
345 aa  95.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  52.38 
 
 
363 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  52.38 
 
 
343 aa  90.5  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  51.22 
 
 
340 aa  90.5  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  51.22 
 
 
343 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  51.22 
 
 
343 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  37.04 
 
 
399 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  35.8 
 
 
363 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  34.57 
 
 
372 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  35.8 
 
 
394 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  39.24 
 
 
357 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  30.86 
 
 
371 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  29.27 
 
 
394 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  29.27 
 
 
394 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  29.27 
 
 
394 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  29.27 
 
 
394 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  30.49 
 
 
396 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  30.49 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  30.49 
 
 
398 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  29.27 
 
 
399 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  27.38 
 
 
387 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  28.05 
 
 
405 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  25.93 
 
 
387 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  33.77 
 
 
342 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  23.81 
 
 
392 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>