46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2207 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  869    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  35.78 
 
 
386 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  31.31 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  33.43 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  29.19 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  31.01 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  32.29 
 
 
401 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  28.99 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  26.75 
 
 
387 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  27.36 
 
 
393 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  27.31 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  27.78 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  27.31 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  27.25 
 
 
428 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  26.05 
 
 
599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  30.66 
 
 
401 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  26.22 
 
 
386 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  25.72 
 
 
419 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  30.58 
 
 
401 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  29.01 
 
 
386 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  23.8 
 
 
580 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  31.49 
 
 
395 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  24.04 
 
 
580 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  23.8 
 
 
576 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  27.08 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  27.71 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  24.88 
 
 
563 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  24.5 
 
 
652 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  25.59 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  25.95 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  25.95 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  30.56 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  25.71 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  28.66 
 
 
373 aa  87  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  25 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  25.12 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  23.3 
 
 
580 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  28.34 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  24.88 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  24.47 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  28.15 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.72 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  29.7 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  26.64 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  25.34 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  30.43 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>