More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0839 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2591  rhodanese-like domain-containing protein  48.96 
 
 		 119 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.459858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.26 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.37 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.34 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  32.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.05 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.96 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 138 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  27.78 
 
 		 459 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.84 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.25 
 
 		 550 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.04 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  29.51 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25.15 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  24.61 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  38.89 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.5 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.51 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  34.57 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 		 568 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 129 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.37 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  32.48 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 143 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  26.36 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 		 142 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 138 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  31.46 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.65 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.65 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.02 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  39.47 
 
 		 129 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  27.38 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  32 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.58 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  27.17 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  27.43 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  27.68 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  37.14 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.8 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  34.57 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  36.76 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  23.78 
 
 		 461 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>