21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0194 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  766    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  38.58 
 
 		 369 aa  209  8e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  26.83 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  32.67 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  27.92 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  29.87 
 
 		 521 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  30.95 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.1 
 
 		 1831 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  27.87 
 
 		 1066 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1028  hypothetical protein  31.82 
 
 		 161 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 1300 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  21.34 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 		 233 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  23.81 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  21.28 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 702 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  21.9 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>