More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11995 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  100 
 
 		 141 aa  274  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  72.14 
 
 		 257 aa  194  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  70.71 
 
 		 256 aa  194  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  68.89 
 
 		 271 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  68.89 
 
 		 271 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  67.41 
 
 		 255 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  68.89 
 
 		 255 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  65.19 
 
 		 255 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  62.22 
 
 		 257 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  60.74 
 
 		 254 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  62.22 
 
 		 250 aa  164  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  59.29 
 
 		 254 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  59.29 
 
 		 254 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  59.29 
 
 		 254 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  58.57 
 
 		 237 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  59.7 
 
 		 269 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  56.43 
 
 		 237 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  59.7 
 
 		 269 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  59.7 
 
 		 266 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  59.7 
 
 		 266 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  59.7 
 
 		 266 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  58.09 
 
 		 270 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  57.35 
 
 		 269 aa  157  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  56.62 
 
 		 270 aa  153  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  58.82 
 
 		 269 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  54.01 
 
 		 265 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  55.88 
 
 		 256 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  55.88 
 
 		 256 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  55.88 
 
 		 256 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  54.01 
 
 		 265 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  53.28 
 
 		 265 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  54.41 
 
 		 270 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  54.41 
 
 		 270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  54.41 
 
 		 270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  51.09 
 
 		 265 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  55.56 
 
 		 254 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  66.67 
 
 		 255 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  49.63 
 
 		 261 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  48.12 
 
 		 262 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  46.62 
 
 		 268 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  53.28 
 
 		 265 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  53.28 
 
 		 265 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  53.28 
 
 		 265 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  45.11 
 
 		 285 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  47.37 
 
 		 267 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  44.36 
 
 		 253 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  43.61 
 
 		 260 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  47.37 
 
 		 257 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.27 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  47.33 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  40.6 
 
 		 269 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  44.35 
 
 		 267 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  39.69 
 
 		 285 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 285 aa  105  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  38.93 
 
 		 285 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  34.81 
 
 		 312 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  34.07 
 
 		 281 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  38.93 
 
 		 272 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  33.83 
 
 		 349 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  39.69 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  32.06 
 
 		 256 aa  83.6  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  32.56 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  33.6 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  35.07 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  31.34 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  29.77 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  32.58 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  37.4 
 
 		 297 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  29.92 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  30.3 
 
 		 268 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  33.82 
 
 		 263 aa  73.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  32.09 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.34 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  32.84 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  31.06 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  30.16 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  31.34 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 		 269 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  28.68 
 
 		 260 aa  72  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  33.07 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  33.08 
 
 		 258 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  33.85 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  31.06 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  26.52 
 
 		 266 aa  70.9  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2987  protein of unknown function DUF140  37.96 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  31.34 
 
 		 275 aa  70.9  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  33.85 
 
 		 255 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  33.85 
 
 		 255 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  30.89 
 
 		 430 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  29.01 
 
 		 257 aa  70.5  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  29.37 
 
 		 366 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  33.08 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  33.08 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  31.34 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  32.31 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>