26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10206 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  100 
 
 
427 aa  847    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  71.9 
 
 
392 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  72.53 
 
 
378 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  72.25 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  72.25 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  72.73 
 
 
367 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  54.86 
 
 
392 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  48.11 
 
 
396 aa  270  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  35.78 
 
 
793 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.05 
 
 
843 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  35.51 
 
 
773 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  34.92 
 
 
783 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  36.73 
 
 
792 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  28.97 
 
 
859 aa  51.2  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  23.76 
 
 
392 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.93 
 
 
847 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.05 
 
 
801 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  30.71 
 
 
339 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  24.23 
 
 
345 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  27.34 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  24.85 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  19.94 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  29.38 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  32.5 
 
 
851 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  33.68 
 
 
281 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  25.64 
 
 
851 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>