50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2246 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2246  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1031    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000470204  normal  0.439852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4007  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  37.36 
 
 
550 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3962  putative glycosyl transferase  37.36 
 
 
550 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1362  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
502 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104719  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0867  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
505 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.955407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1743  glycosyltransferase  27.22 
 
 
513 aa  100  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18820  glycosyl transferase family 39  26.21 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0706746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1646  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4304  hypothetical protein  32.89 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0421  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3206  putative 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.87 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24072  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1292  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.65 
 
 
505 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1362  hypothetical protein  28.11 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0689  glycosyl transferase family 39  22.24 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0066  glycosyl transferase family 39  20.93 
 
 
512 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.545213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3657  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
496 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.658798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1307  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  31.96 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.794979  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2194  hypothetical protein  27.92 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1358  hypothetical protein  24.75 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3122  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.14 
 
 
531 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0865073  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3392  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1393  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
502 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1409  glycosyltransferase  29.75 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1026  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family  26.73 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227195  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2597  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
498 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1801  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3021  hypothetical protein  25.18 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6676  putative glycosyl transferase  29.57 
 
 
509 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.63 
 
 
864 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0550  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  29.34 
 
 
503 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137007  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5296  hypothetical protein  27.61 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.067873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02435  hypothetical protein  31.07 
 
 
622 aa  65.1  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.940814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2556  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  32.86 
 
 
505 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2324  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  24.28 
 
 
528 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3742  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
513 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00121597  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0865  hypothetical protein  28.16 
 
 
611 aa  57  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4699  hypothetical protein  25.07 
 
 
527 aa  57  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0323  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.21 
 
 
528 aa  57  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2632  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.14 
 
 
596 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1006  hypothetical protein  24.77 
 
 
489 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.122487 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1008  hypothetical protein  28.71 
 
 
503 aa  54.3  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.807875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3006  hypothetical protein  22.96 
 
 
475 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1903  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
476 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  23.01 
 
 
812 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1115  hypothetical protein  27.9 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3096  glycosyl transferase family 39  24.85 
 
 
498 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1209  hypothetical protein  27.9 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2024  hypothetical protein  26.85 
 
 
526 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3825  hypothetical protein  32.08 
 
 
959 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3478  hypothetical protein  25.23 
 
 
506 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>