More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1835 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1835  putative glycerol kinase  100 
 
 
501 aa  1008    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0651964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0500  putative glycerol kinase  81.8 
 
 
501 aa  815    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102563  normal  0.0309085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  48.3 
 
 
510 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  45.88 
 
 
495 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  46.4 
 
 
496 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  47.98 
 
 
516 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  45.89 
 
 
520 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  46.68 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  45.97 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  46.68 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  43.03 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  46.69 
 
 
498 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  46.77 
 
 
494 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  47.48 
 
 
502 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  46.69 
 
 
498 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0841  glycerol kinase  41.65 
 
 
494 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0155188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  44.42 
 
 
493 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  45.89 
 
 
494 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45710  glycerol kinase  44.05 
 
 
505 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  45.69 
 
 
494 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  44.67 
 
 
495 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  45.29 
 
 
497 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  44.47 
 
 
498 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  44.38 
 
 
498 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  45.84 
 
 
498 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  45.69 
 
 
494 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  42.12 
 
 
496 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  45.89 
 
 
494 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  46.44 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  43.28 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0399  glycerol kinase  44.44 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  44.29 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  45.64 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  42.91 
 
 
499 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  42.69 
 
 
501 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  46.09 
 
 
494 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  43.8 
 
 
497 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1515  glycerol kinase  46.06 
 
 
484 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  42.28 
 
 
498 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4798  glycerol kinase  43.2 
 
 
502 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000311367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  45.45 
 
 
497 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  45.51 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  46.52 
 
 
497 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  43.23 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0100  glycerol kinase  43.03 
 
 
507 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  42.51 
 
 
499 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  46.69 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0101  glycerol kinase  43.03 
 
 
507 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4113  glycerol kinase  43.03 
 
 
507 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2002  glycerol kinase  45.25 
 
 
500 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  44.47 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  44.96 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  47.57 
 
 
495 aa  402  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  43.43 
 
 
499 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  42.71 
 
 
499 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  44.33 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2324  glycerol kinase  45.56 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0159  glycerol kinase  42.4 
 
 
503 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  43.57 
 
 
505 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002675  glycerol kinase  43.59 
 
 
505 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3803  glycerol kinase  42.89 
 
 
503 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3678  glycerol kinase  46.42 
 
 
496 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  44.65 
 
 
498 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  46 
 
 
505 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0174  glycerol kinase  42 
 
 
503 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  43.75 
 
 
498 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  41.13 
 
 
497 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  43.03 
 
 
505 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  44.58 
 
 
493 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03313  glycerol kinase  43.39 
 
 
505 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  45.09 
 
 
497 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  42.32 
 
 
501 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  43.29 
 
 
494 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  44.89 
 
 
499 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4532  glycerol kinase  42.06 
 
 
500 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422897  normal  0.159359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0342  glycerol kinase  43.78 
 
 
497 aa  395  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00293212  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2621  glycerol kinase  47.19 
 
 
504 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0291  glycerol kinase  44.38 
 
 
496 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.807518  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  42.18 
 
 
502 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3376  glycerol kinase  44.98 
 
 
495 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21570  glycerol kinase  45.11 
 
 
503 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0870  glycerol kinase  44.18 
 
 
495 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.758789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  41.78 
 
 
502 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2627  glycerol kinase  46.55 
 
 
483 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3533  glycerol kinase  45.09 
 
 
499 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.904687  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0041  glycerol kinase  41.77 
 
 
499 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.684813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1598  glycerol kinase  43.37 
 
 
500 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  41.6 
 
 
500 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  41.09 
 
 
498 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>