61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1813 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1813  pfkB family carbohydrate kinase  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1746  pfkB family carbohydrate kinase  66.79 
 
 
288 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12381  putative pfkB family carbohydrate kinase  59.42 
 
 
283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1055  PfkB family carbohydrate kinase  46.45 
 
 
289 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.18758  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11491  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.21 
 
 
289 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0717159  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  47.94 
 
 
289 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11501  putative pfkB family carbohydrate kinase  46.24 
 
 
289 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.605527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11481  putative pfkB family carbohydrate kinase  51.11 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.036183  normal  0.108302 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0709  putative pfkB family carbohydrate kinase  49.11 
 
 
280 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.19808  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15431  putative pfkB family carbohydrate kinase  48.75 
 
 
280 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.345352  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0531  PfkB domain protein  38.49 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0498  carbohydrate kinase, PfkB  38.13 
 
 
285 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0526  PfkB domain protein  38.04 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.387077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1085  PfkB domain protein  39.39 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2912  ribokinase-like domain-containing protein  38.57 
 
 
290 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.140234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.38 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.91 
 
 
360 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.51 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.49 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.97 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
330 aa  49.3  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  23.13 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  26.43 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  23.59 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.47 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.01 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.91 
 
 
299 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  27.63 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.3 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  22.48 
 
 
404 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.25 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.67 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  22.48 
 
 
404 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  22.48 
 
 
404 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  22.48 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  36 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  24.46 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  28.04 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  22.18 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  30.53 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  40.68 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  27.05 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  28.74 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  24.29 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  44 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.27 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.56 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  34.57 
 
 
445 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  38.57 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3857  PfkB domain protein  28.28 
 
 
373 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  32.43 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  23.14 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6055  PfkB domain protein  36.56 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130249  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  54.05 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  54.05 
 
 
321 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  24.83 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.65 
 
 
329 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25 
 
 
325 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>