52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0820 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0820  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  100 
 
 		 376 aa  775    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0392613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.09 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.15 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.93 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  21.02 
 
 		 357 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2578  glycosyl transferase family 9  25 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21.1 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  23.7 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  27.68 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  23.34 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.49 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.97 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.97 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.97 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.32 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1507  heptosyltransferase family protein, putative  21.9 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.45 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  20.83 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  23.51 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2559  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.44 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  28.12 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.44 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  20.18 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  21 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.68 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.44 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  23.67 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.44 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.88 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  19.46 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.44 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  23.44 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.78 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.36 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.3 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.51 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.05 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  22.67 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  21.32 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.8 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.59 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.59 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.59 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.58 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.38 
 
 		 332 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.111821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>