28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1720 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  808    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  83.42 
 
 		 380 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  79.16 
 
 		 390 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  69.15 
 
 		 386 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28561  hypothetical protein  70.59 
 
 		 105 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12991  hypothetical protein  61.96 
 
 		 99 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  27.07 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0939  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  25.96 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13501  hypothetical protein  39.74 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.104266 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  24.03 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  25.99 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  24.18 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4384  integrase family protein  27.75 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal  0.543633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  23.24 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2571  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  22.38 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  24.89 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  24.89 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.31 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>