More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1583 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1583  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
297 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.639711  hitchhiker  0.00905635 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  70.37 
 
 
319 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  63.51 
 
 
318 aa  404  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.18 
 
 
318 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.18 
 
 
318 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.84 
 
 
318 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.18 
 
 
318 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.18 
 
 
318 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.51 
 
 
318 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  63.18 
 
 
318 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  60.47 
 
 
317 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  44.26 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0941  Thioredoxin-disulfide reductase  44.15 
 
 
313 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1451  thioredoxin reductase  41.89 
 
 
322 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0532473  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  39.53 
 
 
313 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  35.19 
 
 
323 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  32.87 
 
 
308 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.05 
 
 
306 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  33.67 
 
 
409 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  34.84 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  34.6 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  32.3 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  35.29 
 
 
309 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  32.99 
 
 
336 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  33 
 
 
318 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  35.07 
 
 
304 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  32.64 
 
 
396 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  35.4 
 
 
334 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  33.1 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  33.67 
 
 
555 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.22 
 
 
306 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  33.92 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  33.45 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.45 
 
 
427 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.68 
 
 
302 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  36.27 
 
 
410 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  34.14 
 
 
310 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0579  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.32 
 
 
325 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 
306 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  32.65 
 
 
306 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  35.19 
 
 
310 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
315 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  32.18 
 
 
310 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  33.9 
 
 
310 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  33.79 
 
 
314 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  33.56 
 
 
638 aa  159  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.99 
 
 
407 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  34.26 
 
 
308 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  32.54 
 
 
330 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  32.78 
 
 
317 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  32.4 
 
 
311 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  32.99 
 
 
311 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  32.41 
 
 
308 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  35.14 
 
 
325 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  33.45 
 
 
313 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  32.3 
 
 
312 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  32.3 
 
 
312 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  31.56 
 
 
317 aa  155  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  30.87 
 
 
319 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  32.25 
 
 
552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  31.54 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  34.24 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  32.53 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  31.88 
 
 
317 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  31.12 
 
 
304 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  32.09 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53290  thioredoxin reductase 2  32.88 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.868588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
318 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  32.18 
 
 
331 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  32.07 
 
 
332 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  31.82 
 
 
317 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  30.8 
 
 
348 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  31.99 
 
 
323 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  32.64 
 
 
319 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  31.08 
 
 
320 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  32.9 
 
 
359 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  31.77 
 
 
317 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485942  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0321  thioredoxin-disulfide reductase  32.78 
 
 
319 aa  150  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  31.77 
 
 
317 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000784195  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  31.77 
 
 
317 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  32 
 
 
304 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  32.19 
 
 
318 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
406 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  32.19 
 
 
318 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  32.19 
 
 
318 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  31.72 
 
 
311 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  32.19 
 
 
318 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  31.79 
 
 
453 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  31.25 
 
 
316 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  31.65 
 
 
320 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  33.79 
 
 
317 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  32.19 
 
 
321 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  32.19 
 
 
321 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  32.19 
 
 
321 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  31.65 
 
 
320 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  31.44 
 
 
317 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  31.65 
 
 
320 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>