22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0903 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1496  NHL repeat-containing protein  64.21 
 
 		 673 aa  867    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 664 aa  1344    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21261  NHL repeat-containing protein  56.58 
 
 		 570 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  29.31 
 
 		 658 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  25.98 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0316  hypothetical protein  26.58 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.58 
 
 		 831 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 		 579 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.21 
 
 		 668 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.37 
 
 		 346 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.96 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  26.77 
 
 		 343 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.63 
 
 		 693 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.79 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  27.27 
 
 		 664 aa  45.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.91 
 
 		 930 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  27.74 
 
 		 695 aa  44.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  23.18 
 
 		 326 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1608 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.61 
 
 		 676 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.49 
 
 		 343 aa  43.9  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.62 
 
 		 353 aa  43.9  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>