145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2697 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 		 236 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  77.54 
 
 		 236 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  64.26 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  65.33 
 
 		 235 aa  324  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  62.77 
 
 		 236 aa  324  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  62.77 
 
 		 236 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  62.77 
 
 		 236 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  62.77 
 
 		 236 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  63.56 
 
 		 238 aa  317  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  63.11 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  63.11 
 
 		 238 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  62.22 
 
 		 238 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  64.94 
 
 		 234 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  60.53 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  60.79 
 
 		 237 aa  291  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  56.89 
 
 		 233 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  48.66 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2216  arginyl-tRNA-protein transferase  44.05 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  42.86 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01638  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  42.59 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  44.59 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  41.85 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  43.89 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  44.14 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  42.99 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  43.44 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  40.77 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  43.44 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  42.99 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  42.99 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  42.99 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  40.77 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  42.15 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  42.15 
 
 		 235 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  39.06 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  40.09 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  39.56 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  38.36 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  36.21 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  38.39 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  37.78 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  37.93 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  37.61 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  36.28 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  35.78 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  34.76 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  34.76 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2242  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.354347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  34.35 
 
 		 254 aa  147  9e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  35.9 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  34.35 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  36.24 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  36.24 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  36.24 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  35.81 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  33.48 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1616  arginyl-tRNA-protein transferase  34.91 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1911  arginyl-tRNA-protein transferase  35.53 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.582376  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1111  arginyl-tRNA-protein transferase  34.89 
 
 		 258 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2986  arginyl-tRNA-protein transferase  37.8 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.575869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1559  arginyl-tRNA-protein transferase  35.44 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  34.62 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  34.22 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1260  arginyl-tRNA-protein transferase  34.89 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.340737 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  34.05 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1603  arginyl-tRNA-protein transferase  34.05 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117832  normal  0.3797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4657  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 		 258 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  34.06 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2649  arginyl-tRNA-protein transferase  34.95 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2506  arginyl-tRNA-protein transferase  33.9 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  33.78 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  36.32 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2538  arginyl-tRNA-protein transferase  35.59 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  33.78 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  34.05 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1127  arginyl-tRNA-protein transferase  33.62 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3351  arginyl-tRNA-protein transferase  36 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.662203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  34.35 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  34.33 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  33.78 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2658  arginyl-tRNA-protein transferase  35.89 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  32.9 
 
 		 248 aa  134  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4292  arginyl-tRNA-protein transferase  34.78 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0755  arginyl-tRNA-protein transferase  34.75 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2621  arginyl-tRNA-protein transferase  36.36 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1601  arginyl-tRNA-protein transferase  32.76 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0750  arginyl-tRNA-protein transferase  34.75 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  34.06 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  35.78 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>