More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1664 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1664  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  100 
 
 
199 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0636  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  67.84 
 
 
207 aa  291  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.678977  normal  0.34007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2648  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  70.05 
 
 
200 aa  288  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1126  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  64.82 
 
 
201 aa  280  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0875109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  63.32 
 
 
207 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  62.12 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1934  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.81 
 
 
199 aa  252  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3034  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  66.15 
 
 
197 aa  249  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104666  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02342  glycosyl transferase transmembrane protein  64.65 
 
 
203 aa  248  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2726  sugar transferase  60.2 
 
 
197 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.18 
 
 
204 aa  246  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3389  sugar transferase  59.6 
 
 
204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.251832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4262  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  61.03 
 
 
206 aa  241  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1345  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.49 
 
 
206 aa  239  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.940885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4005  sugar transferase  60.1 
 
 
206 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  56.92 
 
 
204 aa  237  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0450  Cpp29  56.35 
 
 
201 aa  236  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1211  putative sugar transferase  56.41 
 
 
201 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0586  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.69 
 
 
206 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5365  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  60.71 
 
 
205 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1141  general glycosylation pathway protein  57.36 
 
 
200 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.987369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30050  sugar transferase family protein  62.44 
 
 
198 aa  230  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1266  general glycosylation pathway protein  56.85 
 
 
200 aa  228  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0716  sugar transferase  54.55 
 
 
207 aa  228  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0597  general glycosylation pathway protein  57.36 
 
 
200 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0038  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  59.9 
 
 
210 aa  225  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1381  general glycosylation pathway protein  53.81 
 
 
201 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0574  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  55.28 
 
 
200 aa  224  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.2884  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0952  general glycosylation pathway protein  52.04 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  54.12 
 
 
206 aa  221  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2000  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  54.92 
 
 
215 aa  220  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  55.9 
 
 
598 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1255  galactosyltransferase  57.65 
 
 
200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5254  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  53.06 
 
 
207 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10743  putative undecaprenyl-phosphate glycosyl-1-phosphate transferase  53.54 
 
 
202 aa  209  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2483  sugar transferase  51.79 
 
 
219 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  52.6 
 
 
243 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  52.66 
 
 
230 aa  204  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2344  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  56.59 
 
 
232 aa  197  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  52.72 
 
 
226 aa  197  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1529  putative YVfC-like sugar transferase  53.8 
 
 
226 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.67 
 
 
217 aa  191  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0494  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.52 
 
 
219 aa  175  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  45.41 
 
 
219 aa  167  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1211  sugar transferase; UDP-glucose lipid carrier transferase  43.81 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.343253  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3631  sugar transferase  44.57 
 
 
190 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2852  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  47.34 
 
 
208 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2673  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.49 
 
 
463 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.502401  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2023  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.97 
 
 
201 aa  153  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  hitchhiker  0.0000000000460797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16230  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  42.33 
 
 
459 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  40.98 
 
 
185 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  40.98 
 
 
185 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1519  sugar transferase  41.71 
 
 
214 aa  150  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1693  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  41.27 
 
 
346 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000262579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.16 
 
 
491 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1063  sugar transferase  41.49 
 
 
432 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41545  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4579  sugar transferase  39.89 
 
 
226 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.81 
 
 
463 aa  148  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  40.54 
 
 
494 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08350  glycosyl transferase possibly involved in lipopolysaccharide synthesis  38.97 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.163172  normal  0.229141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0062  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.44 
 
 
457 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2436  sugar transferase  38.34 
 
 
460 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.404027  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0418  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.25 
 
 
495 aa  144  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2699  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.61 
 
 
477 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0831  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  42.86 
 
 
474 aa  143  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1979  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.05 
 
 
457 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0160004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  39.38 
 
 
461 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.76 
 
 
498 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0295  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.58 
 
 
408 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1382  sugar transferase  44.68 
 
 
466 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.254818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  41.71 
 
 
490 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.29 
 
 
456 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4056  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  39.36 
 
 
471 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2860  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  42.02 
 
 
468 aa  141  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.41 
 
 
470 aa  141  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4240  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.94 
 
 
462 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.322469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.74 
 
 
464 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.250613  normal  0.0594432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0462  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  41.97 
 
 
448 aa  141  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00445069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1801  sugar transferase  41.85 
 
 
471 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.645095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.66 
 
 
498 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1015  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  41.49 
 
 
464 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.742651  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0496  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  44.31 
 
 
467 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1070  sugar transferase  42.47 
 
 
469 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2190  sugar transferase  42.42 
 
 
475 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000191042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1535  sugar transferase  40.41 
 
 
469 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1001  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.27 
 
 
491 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0535  polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  41.18 
 
 
461 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0595  sugar transferase family protein  37.82 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.750917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01953  predicted UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00395931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1610  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000013392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2981  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2339  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2376  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.08 
 
 
461 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01942  hypothetical protein  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1185  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1594  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  40.96 
 
 
464 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2661  putative UDP-glucose lipid carrier transferase  41.49 
 
 
464 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0848752  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3721  sugar transferase  42.78 
 
 
362 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.243024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3300  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  41.3 
 
 
468 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.609439  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4217  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.3 
 
 
468 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>