More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0914 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3221  glutathione synthetase  90.86 
 
 		 339 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0914  glutathione synthetase  100 
 
 		 345 aa  711    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0474988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2899  glutathione synthetase  63.08 
 
 		 344 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000207563  normal  0.923755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  60.65 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1597  glutathione synthetase  49.28 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.890547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  35.74 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  34.24 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  34.23 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  34.37 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  32.53 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  32.93 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  33.14 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  33.14 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  32.92 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  33.54 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  32.53 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  33.73 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  31.61 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  32.33 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  35.4 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  32.05 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  35.71 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  30.65 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  30.7 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  30.51 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  31.37 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  31.69 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  31.15 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  30.03 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  31.37 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  30.35 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  32.27 
 
 		 314 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  31.63 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  31.08 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  30.03 
 
 		 314 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  30.25 
 
 		 313 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  31.08 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  29.52 
 
 		 320 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  30.09 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2440  glutathione synthetase  31.29 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  31.31 
 
 		 312 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0145  glutathione synthetase  30.03 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  31.31 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  28.48 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  31.91 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  31.6 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  32.92 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02071  glutathione synthetase  33.23 
 
 		 307 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  31.58 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  31.17 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  31.38 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  32.52 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  30.03 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0178  glutathione synthetase  31.89 
 
 		 317 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  28.26 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  31.69 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  31.38 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  32.3 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  31.79 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  30.94 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  31.79 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  31.79 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  30.86 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0401  glutathione synthetase  28.26 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  30.34 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01961  glutathione synthetase  31.97 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  30.82 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  30.82 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27361  glutathione synthetase  31.97 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  32.04 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  32.09 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0180  glutathione synthetase  31.56 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.812425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  29.72 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  32.4 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  31.48 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  28.99 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  31.08 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  31.48 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  31.72 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01981  glutathione synthetase  31.25 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0769022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  30.25 
 
 		 320 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  30.51 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01961  glutathione synthetase  31.15 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  29.81 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  32.01 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  30.51 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  31.87 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  30.61 
 
 		 317 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  30.18 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  30.3 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  29.36 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  29.69 
 
 		 314 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  27.99 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  30.3 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  31.25 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  31.25 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>