More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0666 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  100 
 
 		 348 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0606  glutathione synthetase  86.78 
 
 		 348 aa  628  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000326698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  61.21 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  51.72 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  48.25 
 
 		 348 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  32.25 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  30.75 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  30.72 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  32.94 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  28.4 
 
 		 320 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  35.16 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  32.94 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  35.16 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  34.77 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  31.21 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  32.2 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  31.33 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  30.54 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  33.72 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  32.55 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  31.01 
 
 		 315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 317 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  29.63 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  31.65 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  29.85 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  32.32 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  32.95 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  32.95 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  27.62 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  27.41 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  31.15 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  30.59 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  29.85 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  30.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  30.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  30.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  30.79 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  33.86 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  32.68 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  32.94 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  33.33 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  32.8 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  32.28 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  32.28 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  30.09 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  31.89 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  30.43 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  31.29 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  33.46 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  31.66 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  31.95 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  27.64 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  29.73 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  29.62 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  31.2 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  27.64 
 
 		 334 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  30.56 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  34.85 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  29.17 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  31.58 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  31.27 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3221  glutathione synthetase  29.32 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  31.27 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  31.37 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  31.45 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  30.79 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  31.27 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  30.96 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  28.4 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  31.04 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  32.56 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  29.15 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0914  glutathione synthetase  27.99 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0474988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  30.65 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  30.15 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  30.5 
 
 		 317 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  30.41 
 
 		 318 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  30.84 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  32.08 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2899  glutathione synthetase  25.66 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000207563  normal  0.923755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  28.88 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>