More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1597 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1597  glutathione synthetase  100 
 
 		 350 aa  718    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.890547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0914  glutathione synthetase  49.28 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0474988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3221  glutathione synthetase  49.7 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2899  glutathione synthetase  47.54 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000207563  normal  0.923755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  49.06 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  31.63 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4048  glutathione synthetase  32.74 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4010  glutathione synthetase  32.74 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  30.75 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  31.31 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  29.04 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  31.8 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  31.82 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02531  glutathione synthetase  30.89 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1546  glutathione synthetase  30.67 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  29.39 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  30.03 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  28.2 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  29.09 
 
 		 320 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  30.28 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  30.06 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  30.06 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27361  glutathione synthetase  27.71 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01961  glutathione synthetase  27.95 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0106  glutathione synthetase  27.91 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0534673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2078  glutathione synthetase  27.61 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00378779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0338  glutathione synthetase  29.49 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.541659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  29.75 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  29.1 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2025  glutathione synthetase  27.3 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  27.62 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  27.36 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0319  glutathione synthetase  28.09 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  26.55 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0935  glutathione synthetase  28.79 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.263345  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  28.7 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  28.7 
 
 		 316 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  28.88 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2440  glutathione synthetase  27.64 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  28.75 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  28.75 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  28.75 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  27.3 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  28.66 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2121  glutathione synthetase  27.36 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  28 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  26.89 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  28.62 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  27.3 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  31.02 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0872  glutathione synthetase  28.1 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0342772  hitchhiker  0.000771754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  32.78 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  27.74 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  28.44 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  28.83 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0606  glutathione synthetase  26.24 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000326698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02071  glutathione synthetase  28.53 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  27.13 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0180  glutathione synthetase  27.16 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  25.23 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  28.05 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  28.39 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  27.88 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0117  glutathione synthetase  29.03 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.376363  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  28.35 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  27.27 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_002978  WD0322  glutathione synthetase  29.01 
 
 		 309 aa  133  6e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  28.18 
 
 		 316 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  29.15 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  29.15 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  27.52 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  26.52 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  26.05 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2798  glutathione synthetase  27.05 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  28.35 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0324  glutathione synthetase  28.25 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.581413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0419  glutathione synthetase  27.92 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  25.53 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3126  glutathione synthetase  28.4 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  27.91 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01961  glutathione synthetase  28.7 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  26.22 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  26.14 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1113  glutathione synthetase  27.08 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68632  normal  0.482887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  27.58 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  25.84 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  27.62 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  27.74 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  27.61 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  27.3 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  27.41 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0180  glutathione synthetase  28.22 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.812425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  27.91 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>