More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0606 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0606  glutathione synthetase  100 
 
 
348 aa  717    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000326698  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0666  glutathione synthetase  86.78 
 
 
348 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3083  glutathione synthetase  62.93 
 
 
347 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224421  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05120  glutathione synthetase  52.59 
 
 
347 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.545798  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4907  glutathione synthetase  48.54 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0049  glutathione synthetase  31.68 
 
 
317 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0437692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  31.38 
 
 
317 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0473  glutathione synthetase  33.96 
 
 
314 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.031905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  31.85 
 
 
317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3585  glutathione synthetase  33.75 
 
 
316 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.676094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  36.55 
 
 
319 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1815  glutathione synthetase  33.02 
 
 
316 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0901  glutathione synthetase  32.48 
 
 
314 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  36.55 
 
 
319 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3546  glutathione synthetase  33.75 
 
 
315 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  33.02 
 
 
319 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  33.86 
 
 
318 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0462  glutathione synthetase  32.71 
 
 
314 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0450  glutathione synthetase  32.13 
 
 
311 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.319329  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  33.07 
 
 
316 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  36.14 
 
 
319 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  31.08 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  31.08 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  31.08 
 
 
317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3299  glutathione synthetase  30.47 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3379  glutathione synthetase  31.33 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  30.77 
 
 
317 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  33.59 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4337  glutathione synthetase  32.93 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326757  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02777  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0748  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0825243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3089  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00631084  hitchhiker  0.0000073665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3290  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.371812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02740  hypothetical protein  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4250  glutathione synthetase  31.01 
 
 
315 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  0.275432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3105  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0767  glutathione synthetase  31.01 
 
 
316 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0268001  hitchhiker  0.00000369912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  32.68 
 
 
316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  30.86 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  31.79 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  31.65 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0361  glutathione synthetase  35.96 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.871301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  34.36 
 
 
328 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  31.01 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  31.01 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  31.01 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  31.01 
 
 
315 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  33.46 
 
 
315 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  32.4 
 
 
318 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4828  glutathione synthetase  29.46 
 
 
322 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  30.72 
 
 
315 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  31.75 
 
 
315 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4600  glutathione synthetase  32.92 
 
 
315 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4206  glutathione synthetase  30.23 
 
 
324 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1904  glutathione synthetase  28.11 
 
 
320 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.337378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  30.25 
 
 
315 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3960  glutathione synthetase  33.23 
 
 
316 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0783  glutathione synthetase  32.4 
 
 
312 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2324  glutathione synthetase  30.21 
 
 
323 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3690  glutathione synthetase  32.19 
 
 
318 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0298114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3589  glutathione synthetase  32.06 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0573  glutathione synthetase  30.25 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230424  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  33.33 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  34 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3711  glutathione synthetase  32.81 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0476586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3909  glutathione synthetase  32.81 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000043929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  34.13 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3351  glutathione synthetase  33.47 
 
 
315 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000368137  decreased coverage  0.00227913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  29.78 
 
 
316 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4323  glutathione synthetase  31.35 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2829  glutathione synthetase  30.42 
 
 
315 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  0.703083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  32.7 
 
 
318 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1229  glutathione synthetase  31.85 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3063  glutathione synthetase  33.12 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2670  glutathione synthetase  33.12 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  33.86 
 
 
319 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  31.66 
 
 
318 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0322  glutathione synthetase  33.91 
 
 
334 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.720886  normal  0.322708 
 
 
-
 
NC_004310  BR2131  glutathione synthetase  31.46 
 
 
312 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1836  glutathione synthetase  28.24 
 
 
324 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  32.38 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  30.09 
 
 
316 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  32.34 
 
 
317 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0876  glutathione synthetase  30.15 
 
 
320 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  34.8 
 
 
314 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0722  glutathione synthetase  31.68 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  37.2 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2047  glutathione synthetase  31.46 
 
 
312 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00139246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  35.38 
 
 
315 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  36.4 
 
 
318 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11008  glutathione synthetase  30.29 
 
 
338 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.59578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3016  glutathione synthetase  31.97 
 
 
316 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0901  glutathione synthetase  29.85 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.382175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0939  glutathione synthetase  29.85 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0625904  normal  0.13486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>