154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5369 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5369  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  587  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.22718 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  60.07 
 
 
298 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2160  hypothetical protein  50.92 
 
 
304 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695794  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.82 
 
 
241 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2318  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  28.42 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132945  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  26.97 
 
 
245 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  29.03 
 
 
242 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.41 
 
 
241 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0346  disulfide isomerase  27.49 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142829  normal  0.435746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.61 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.03 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.52 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  28.67 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  28.32 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  28.67 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  28.67 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  27.2 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  28.67 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.74 
 
 
210 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  28.32 
 
 
242 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.61 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0771  chitinase  25.59 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.902637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  27.02 
 
 
245 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02667  disulfide isomerase  27.84 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  26.52 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  29.45 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.27 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  27.27 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  25.29 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0683  disulfide isomerase  26.03 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.2 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  25.28 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1537  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  26.98 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.584285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3663  putative protein disulfide-isomerase  25.46 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.97 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  22.81 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.87 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0541  protein disulfide isomerase precursor  27.63 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474105  normal  0.954395 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  23.27 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  24.7 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  21.95 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0896  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.28 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0771  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.74 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.64 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2445  putative thiol:disulphide interchange protein  25.09 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0748  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.76 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000286403  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6799  protein-disulfide isomerase  26.91 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  24.52 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0894  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.91 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0100675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25 
 
 
242 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  22.9 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03408  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.54 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2681  hypothetical protein  28.51 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000484489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  21.99 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2157  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.48 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3505  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.26 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.616038  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1944  protein-disulfide isomerase-like protein  31.82 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  22.99 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.1 
 
 
241 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.85 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.55 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.51 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4095  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.82 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3330  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.13 
 
 
241 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2331  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.02 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39500  Disulfide bond isomerase  29.1 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0796  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.13 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3227  thiol:disulfide interchange protein DsbC  34.13 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.28 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.48 
 
 
238 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  33.59 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.28 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.28 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  21.45 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.88 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  30.08 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3713  thiol:disulfide interchange protein DsbC  23.61 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.55 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0664  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.73 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0629017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.75 
 
 
237 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1535  hypothetical protein  24.08 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.480424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.53 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0806  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.3 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  23.67 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2730  disulfide bond isomerase  24.07 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  21.43 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.78 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.48 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>