59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4355 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 347 aa  700    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2246  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  42.41 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  40.13 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  36.04 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  32.62 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  38.13 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  37.13 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3344  aminoglycoside phosphotransferase  36.82 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  32.27 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3252  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2425  aminoglycoside phosphotransferase  31.64 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.55374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1068  aminoglycoside phosphotransferase  31.58 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.029668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  21.43 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  21.1 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  21.1 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  20.45 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  22.55 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  20.78 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  23.6 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  23.6 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  24.3 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  23.29 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  22.68 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  22.67 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  22.61 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  22.76 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  23.28 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 528 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  21.72 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  21.13 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  21.89 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  26.02 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  25.93 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1872  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  19.38 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  29.29 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  27.55 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  23.77 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2688  homoserine kinase  39.51 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.296011  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3744  homoserine kinase  39.51 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4711  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  23.86 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  24.47 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  31.52 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3266  homoserine kinase  34.78 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.401105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0505  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00132801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>