51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3657 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  100 
 
 		 490 aa  979    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  59.53 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  62.03 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  59.57 
 
 		 511 aa  558  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  60.08 
 
 		 504 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  59.72 
 
 		 492 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  61.9 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  58.35 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  61.11 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  60.77 
 
 		 511 aa  541  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  58.62 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  57.72 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  58.35 
 
 		 504 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  58.93 
 
 		 510 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  57.14 
 
 		 506 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  58.22 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  56.94 
 
 		 516 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  59.35 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  57.63 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  57.43 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62.2 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  57.43 
 
 		 499 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  58.1 
 
 		 498 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  55.65 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  54.62 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  26.96 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  24.64 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  26.56 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  27.35 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  25.31 
 
 		 659 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  25.32 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  25.71 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2018  FtsK/SpoIIIE family protein  26.99 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  22.28 
 
 		 560 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  32 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  32 
 
 		 608 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  24.73 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  31.73 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.38 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  24.42 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0804  protein of unknown function DUF87  26.52 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  26.52 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  29.63 
 
 		 603 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 664 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  30.08 
 
 		 574 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  27.53 
 
 		 601 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  31.68 
 
 		 1076 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  28.03 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0805  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.86 
 
 		 1467 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0756  hypothetical protein  28.12 
 
 		 645 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00608077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>