More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3612 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  79.8 
 
 		 502 aa  752    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  84.2 
 
 		 502 aa  808    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 502 aa  975    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  67.93 
 
 		 512 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  67.13 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  68.13 
 
 		 512 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  65.94 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  67.93 
 
 		 512 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  67.72 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  65.15 
 
 		 516 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  63.55 
 
 		 512 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  65.87 
 
 		 512 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  65.67 
 
 		 512 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  66.87 
 
 		 512 aa  598  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  65.08 
 
 		 512 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  65.74 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  61 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  65.65 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  61.83 
 
 		 516 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  63 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  61 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  61 
 
 		 510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  63.13 
 
 		 510 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  66.2 
 
 		 506 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  60 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  60.76 
 
 		 500 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  59.33 
 
 		 532 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  59.2 
 
 		 510 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  55.69 
 
 		 510 aa  550  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  63.94 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  59.15 
 
 		 504 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  60.6 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  61.32 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  58.74 
 
 		 513 aa  532  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  52.1 
 
 		 502 aa  521  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  49.3 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  58.23 
 
 		 512 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  58.23 
 
 		 512 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  57.34 
 
 		 510 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  57.83 
 
 		 509 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  56.44 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.32 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.61 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 		 520 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  45.74 
 
 		 512 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  45.98 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  51.8 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.73 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  49.08 
 
 		 505 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  46.03 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  48.88 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  45.83 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  47.33 
 
 		 508 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.79 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  48.46 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  45.54 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  45.13 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 510 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 513 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  51.3 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  51.49 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  46.32 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  45.02 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  43.03 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  49.31 
 
 		 510 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  45.74 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.22 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50.3 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  46.52 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  46.52 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  49.02 
 
 		 515 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  47.51 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  43.74 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  49.24 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  45.84 
 
 		 512 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  49.81 
 
 		 517 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.41 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  45.24 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  45.63 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  45.13 
 
 		 509 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 530 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  45.73 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  49.39 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  48.21 
 
 		 511 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  46.92 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  44.05 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  45.58 
 
 		 516 aa  415  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  49.49 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  46.25 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  44.35 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  47 
 
 		 510 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  46.02 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  42.38 
 
 		 516 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  48.59 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  47.72 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>