More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  59.65 
 
 
348 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  50 
 
 
358 aa  344  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  51.49 
 
 
351 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  51.49 
 
 
351 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  51.49 
 
 
351 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  48.19 
 
 
357 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  47.32 
 
 
353 aa  308  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  47.31 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  49.7 
 
 
345 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  49.56 
 
 
348 aa  292  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  47.66 
 
 
347 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  49.56 
 
 
355 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  46.83 
 
 
346 aa  285  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  46.83 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  42.12 
 
 
356 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  43.98 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  43.84 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  48.4 
 
 
346 aa  272  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  42.82 
 
 
346 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  43.8 
 
 
349 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  45.09 
 
 
346 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  42.82 
 
 
346 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  43.61 
 
 
365 aa  255  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  45.3 
 
 
366 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  42.17 
 
 
355 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  45.54 
 
 
347 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  41.44 
 
 
376 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  40.79 
 
 
352 aa  223  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  39.44 
 
 
353 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  39.77 
 
 
354 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  39.2 
 
 
354 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  37.54 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  33.05 
 
 
446 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  36.86 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  34.1 
 
 
440 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  30.18 
 
 
444 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  35.99 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.2 
 
 
448 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  36.09 
 
 
344 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  35.31 
 
 
463 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 
449 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  30.35 
 
 
444 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  36.28 
 
 
333 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  31.6 
 
 
449 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  31.6 
 
 
449 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
437 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  30.54 
 
 
439 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.11 
 
 
451 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  35.46 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  34.54 
 
 
449 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  33.14 
 
 
520 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  28.94 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  28.94 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  28.94 
 
 
451 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.62 
 
 
446 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.84 
 
 
446 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
361 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  34.1 
 
 
446 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
361 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31.01 
 
 
432 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  33.43 
 
 
457 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
443 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  34.65 
 
 
337 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  29.68 
 
 
445 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  31.01 
 
 
432 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  31.01 
 
 
432 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5608  hypothetical protein  34.67 
 
 
446 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.791524  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  33.43 
 
 
451 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.65 
 
 
451 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  31.23 
 
 
437 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  31.01 
 
 
432 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
437 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 
432 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 
342 aa  169  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
336 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  35.06 
 
 
451 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.43 
 
 
432 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  32.68 
 
 
446 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  32.68 
 
 
446 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  33.05 
 
 
431 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.43 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  34.02 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  31.96 
 
 
437 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  28.66 
 
 
443 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  27.7 
 
 
435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.38 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  28.53 
 
 
443 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.99 
 
 
442 aa  166  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  27.7 
 
 
435 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  33.81 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  28.53 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  34.04 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.13627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5369  hypothetical protein  33.52 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.086595  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  27.7 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  27.7 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  27.7 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  27.7 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  28.7 
 
 
443 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>