More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4406 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5322  hypothetical protein  78.65 
 
 		 446 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  80.22 
 
 		 446 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  80.45 
 
 		 446 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5608  hypothetical protein  79.91 
 
 		 446 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.791524  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  79.33 
 
 		 446 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  78.35 
 
 		 463 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5230  hypothetical protein  78.65 
 
 		 446 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  79.55 
 
 		 446 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  79.15 
 
 		 446 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5369  hypothetical protein  78.88 
 
 		 446 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.086595  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.13627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  47.92 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2869  putative CorC/HlyC Co++/Mg++ transporter  47.69 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4386  hypothetical protein  48.27 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  0.867056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3676  hypothetical protein  47.58 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0399185  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4513  hypothetical protein  47.58 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3851  hypothetical protein  47.58 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0288  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2575  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3748  hypothetical protein  47.34 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149108  normal  0.226632 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3219  hypothetical protein  47.34 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4894  hypothetical protein  47.11 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149566  hitchhiker  0.000112878 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0877  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2245  hypothetical protein  47.72 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0633281 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2439  putative transporter  48.15 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  48.2 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0320  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1468  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1665  CBS domain-containing protein  48.15 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310496  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0584  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  42 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0646  hypothetical protein  41.67 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1719  protein of unknown function DUF21  42.69 
 
 		 449 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.444984  normal  0.388918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2061  CBS domain protein  42.69 
 
 		 449 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.95 
 
 		 446 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  37.29 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.59 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  38.26 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  34.69 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  36.63 
 
 		 450 aa  246  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  34.91 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  34.73 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  32.93 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  35 
 
 		 439 aa  239  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  34.1 
 
 		 448 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  34.95 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  34.95 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  35.39 
 
 		 446 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  34.95 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  36.71 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  34.71 
 
 		 442 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  34.47 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  34.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  34.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  35.01 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  34.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  34.44 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  34.62 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  34.47 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  34.71 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  36.45 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  33.25 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36.83 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  34.7 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  35.96 
 
 		 456 aa  232  9e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  32.63 
 
 		 443 aa  230  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.79 
 
 		 432 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.02 
 
 		 432 aa  230  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  35.77 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  34.49 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  34.39 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  32.16 
 
 		 443 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  37.38 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.32 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.25 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  34.39 
 
 		 435 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  32.46 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  32.85 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  35.27 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.32 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.32 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.55 
 
 		 432 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  32.46 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.49 
 
 		 442 aa  226  6e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  35.03 
 
 		 437 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  32.87 
 
 		 446 aa  226  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.08 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  34.97 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  32.37 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  35.32 
 
 		 433 aa  223  8e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  34.5 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>