More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3748 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0288  CBS domain-containing protein  88.59 
 
 
446 aa  809    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0877  CBS domain-containing protein  89.04 
 
 
446 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2245  hypothetical protein  96.42 
 
 
447 aa  876    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0633281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0584  CBS domain-containing protein  88.14 
 
 
446 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4386  hypothetical protein  80.5 
 
 
447 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  0.867056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2869  putative CorC/HlyC Co++/Mg++ transporter  81.41 
 
 
447 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4513  hypothetical protein  96.64 
 
 
447 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0320  CBS domain-containing protein  88.81 
 
 
446 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  82.99 
 
 
447 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4894  hypothetical protein  93.96 
 
 
447 aa  856    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149566  hitchhiker  0.000112878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3219  hypothetical protein  99.55 
 
 
447 aa  897    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3676  hypothetical protein  96.42 
 
 
447 aa  874    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0399185  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3748  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149108  normal  0.226632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3851  hypothetical protein  96.64 
 
 
447 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2439  putative transporter  88.81 
 
 
446 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1468  CBS domain-containing protein  88.81 
 
 
446 aa  810    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2575  CBS domain-containing protein  88.81 
 
 
446 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1665  CBS domain-containing protein  88.81 
 
 
446 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310496  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  61.5 
 
 
437 aa  535  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  47.3 
 
 
437 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0646  hypothetical protein  47.45 
 
 
439 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  49.54 
 
 
446 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  49.54 
 
 
446 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5322  hypothetical protein  48.05 
 
 
446 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2061  CBS domain protein  50.24 
 
 
449 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1719  protein of unknown function DUF21  50.24 
 
 
449 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.444984  normal  0.388918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5230  hypothetical protein  48.05 
 
 
446 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5369  hypothetical protein  47.83 
 
 
446 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.086595  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  47.24 
 
 
446 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  45.45 
 
 
463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  46.71 
 
 
446 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.13627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  46.42 
 
 
446 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5608  hypothetical protein  45.72 
 
 
446 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.791524  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  46.19 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.19 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.86 
 
 
437 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.6 
 
 
442 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  35.96 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  34.81 
 
 
428 aa  250  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.92 
 
 
448 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 
439 aa  245  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.97 
 
 
440 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.77 
 
 
440 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  31.75 
 
 
442 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 
451 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.49 
 
 
451 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  31.75 
 
 
442 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.49 
 
 
451 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  33.78 
 
 
434 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.75 
 
 
442 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  31.52 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.75 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.52 
 
 
442 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  29.88 
 
 
443 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.29 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  35.17 
 
 
431 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  32.58 
 
 
428 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  29.26 
 
 
451 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.41 
 
 
443 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 
444 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.56 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  32.65 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.63 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.65 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.65 
 
 
443 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  34.4 
 
 
440 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 
432 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.27 
 
 
435 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.79 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.79 
 
 
449 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  32.2 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  32.2 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  32.2 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  32.2 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.03 
 
 
451 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
449 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  32.87 
 
 
435 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
446 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.84 
 
 
432 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
435 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
435 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.59 
 
 
432 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
430 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
453 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.35 
 
 
432 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.59 
 
 
432 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.59 
 
 
432 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.89 
 
 
443 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  34.34 
 
 
450 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  31.98 
 
 
437 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.49 
 
 
425 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  31.35 
 
 
441 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.56 
 
 
442 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  34.98 
 
 
449 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  31.6 
 
 
432 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 
437 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  32.81 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.27 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>