More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5369 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5322  hypothetical protein  99.1 
 
 		 446 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5479  transporter, putative  87.44 
 
 		 446 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5034  CBS-domain containing protein  87.22 
 
 		 446 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0152  hypothetical protein  95.96 
 
 		 446 aa  815    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5608  hypothetical protein  88.79 
 
 		 446 aa  776    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.791524  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5230  hypothetical protein  99.33 
 
 		 446 aa  888    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.126895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5369  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  894    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.086595  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6141  hypothetical protein  82.47 
 
 		 446 aa  742    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4406  hypothetical protein  78.88 
 
 		 446 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.13627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70770  hypothetical protein  82.51 
 
 		 446 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48540  hypothetical protein  75.39 
 
 		 463 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0608303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6830  protein of unknown function DUF21  47.94 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.726657 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2439  putative transporter  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273576  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0288  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0320  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2869  putative CorC/HlyC Co++/Mg++ transporter  47.25 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1468  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1665  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310496  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2575  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0877  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4513  hypothetical protein  48.86 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3851  hypothetical protein  48.86 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4894  hypothetical protein  48.51 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149566  hitchhiker  0.000112878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3748  hypothetical protein  47.95 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149108  normal  0.226632 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2245  hypothetical protein  48.75 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0633281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3676  hypothetical protein  48.64 
 
 		 447 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0399185  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4386  hypothetical protein  46.91 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal  0.867056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  48.68 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3219  hypothetical protein  47.73 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0584  CBS domain-containing protein  48.12 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0662  hypothetical protein  45.83 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0646  hypothetical protein  44.89 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1719  protein of unknown function DUF21  42.69 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.444984  normal  0.388918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2061  CBS domain protein  42.69 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  37.77 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  37.59 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  35.92 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  37.14 
 
 		 450 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  33.49 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.49 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  35.17 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36.72 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  33.33 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  33.33 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  33.33 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  33.33 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  32.78 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  32.78 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  32.87 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  32.64 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  36.69 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  32.64 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  32.64 
 
 		 451 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  32.86 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  33.66 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  34.33 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  32.15 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  33.17 
 
 		 432 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  33.17 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.32 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.41 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.16 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  33.66 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  33.17 
 
 		 432 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  35.99 
 
 		 449 aa  230  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  33.57 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.6 
 
 		 442 aa  230  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  32.18 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  32.78 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  36.2 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  34.65 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.45 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  34.7 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  33.5 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.04 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  32.13 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.54 
 
 		 442 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.36 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.04 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.04 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.8 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.04 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  34.76 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  33.76 
 
 		 437 aa  220  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.8 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  35.81 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  35.81 
 
 		 449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>