More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 393 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  80.46 
 
 		 397 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0433  acetyl-CoA acetyltransferase  82.44 
 
 		 393 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1520  thiolase  80.92 
 
 		 393 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  52.96 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  52.17 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  49.62 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  51.41 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  50.64 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  49.36 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  50.89 
 
 		 396 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  50.9 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  49.74 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  50.26 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  49.36 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  50.38 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.59 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 		 394 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  50.13 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  50.64 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  49.36 
 
 		 394 aa  352  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  49.87 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  49.87 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  49.62 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  51.54 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  48.08 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  49.87 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  50.88 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  52.14 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  51.16 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  51.54 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  50.63 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  48.59 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  50.77 
 
 		 393 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  50.38 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  48.35 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  48.35 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.6 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 391 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 		 390 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  46.41 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  44.87 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  44.87 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 		 394 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  47.42 
 
 		 390 aa  332  5e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 393 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  47.84 
 
 		 394 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 		 393 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 		 392 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  47.84 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  47.57 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  48.35 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  45.01 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 394 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  47.84 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  47.84 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  45.41 
 
 		 393 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  48.35 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  48.09 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  47.84 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  45.8 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  48.09 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  50.9 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>