More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  100 
 
 		 612 aa  1222    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  61.8 
 
 		 620 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2007  gamma-glutamyltransferase  60.36 
 
 		 613 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.408979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2332  gamma-glutamyltransferase  60.87 
 
 		 602 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.167584  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  55.98 
 
 		 595 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  59.58 
 
 		 614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2611  gamma-glutamyltransferase  54.61 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  56.14 
 
 		 596 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2446  gamma-glutamyltransferase  54.55 
 
 		 624 aa  538  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605656  normal  0.196083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5929  gamma-glutamyltransferase  52.54 
 
 		 628 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5232  gamma-glutamyltransferase  55.32 
 
 		 605 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  47.28 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3272  gamma-glutamyltransferase 1  46.14 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4005  gamma-glutamyltransferase  43.32 
 
 		 593 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  41.02 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0675  gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 		 596 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2574  gamma-glutamyltranspeptidase  36.3 
 
 		 588 aa  332  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1044  gamma-glutamyltransferase 1  39.11 
 
 		 586 aa  326  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0698667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002088  gamma-glutamyltranspeptidase  36.62 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2637  gamma-glutamyltransferase  40.94 
 
 		 595 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00348  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 		 588 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  38.86 
 
 		 594 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  36.64 
 
 		 583 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  35.31 
 
 		 581 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 		 581 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  36.57 
 
 		 576 aa  318  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  36.98 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  37.34 
 
 		 581 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  37.89 
 
 		 583 aa  316  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  36.91 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  36.91 
 
 		 645 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  38.23 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  36.97 
 
 		 580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  35.57 
 
 		 599 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  37.88 
 
 		 580 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  37.88 
 
 		 580 aa  313  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  37.88 
 
 		 580 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  41.06 
 
 		 601 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  37.57 
 
 		 617 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  37.88 
 
 		 580 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  37.7 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0916  gamma-glutamyltransferase  38.2 
 
 		 586 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  36.84 
 
 		 580 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  37.01 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  36.46 
 
 		 582 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  36.81 
 
 		 580 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  37.88 
 
 		 577 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  37.91 
 
 		 590 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 		 556 aa  309  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  36.81 
 
 		 580 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 		 580 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  36.81 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  35.52 
 
 		 619 aa  307  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  39.04 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  36.45 
 
 		 579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2150  gamma-glutamyltranspeptidase  34.95 
 
 		 586 aa  306  9.000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  40.1 
 
 		 583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4553  gamma-glutamyltransferase  39.96 
 
 		 586 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420864  decreased coverage  0.00202761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0192  gamma-glutamyltransferase 1  41.37 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  38.28 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0310  gamma-glutamyltransferase  38.39 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  38.07 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  39.17 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  36.75 
 
 		 604 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  39.44 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  35.88 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  35.7 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  35.19 
 
 		 580 aa  294  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0194  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 		 668 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  35.7 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0200  gamma-glutamyltransferase  36.15 
 
 		 668 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  36.43 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  39.13 
 
 		 576 aa  293  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  37.25 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  38.7 
 
 		 594 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  36.47 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  35.7 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  35.7 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  35.7 
 
 		 579 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  36.27 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  36.11 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  36.11 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0681  gamma-glutamyltransferase  36.32 
 
 		 575 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2655  gamma-glutamyltransferase  40.84 
 
 		 619 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  42.06 
 
 		 587 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  35.89 
 
 		 587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0016  gamma-glutamyltransferase  37.3 
 
 		 596 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  37.35 
 
 		 586 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  35.4 
 
 		 560 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  35.28 
 
 		 575 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  38.88 
 
 		 610 aa  282  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 576 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  36.69 
 
 		 576 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  34.64 
 
 		 593 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0462  gamma-glutamyltransferase  38.5 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2267  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 		 624 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2882  gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 		 624 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>