More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  50 
 
 		 857 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  50 
 
 		 857 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.2 
 
 		 824 aa  713    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  48.58 
 
 		 812 aa  751    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  46.93 
 
 		 865 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  50.66 
 
 		 940 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.76 
 
 		 817 aa  772    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1335  ATP-dependent protease  47.47 
 
 		 862 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.255547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.64 
 
 		 811 aa  769    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  46.7 
 
 		 861 aa  731    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48 
 
 		 874 aa  711    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  47.84 
 
 		 857 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.64 
 
 		 811 aa  769    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  51.64 
 
 		 811 aa  769    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  51.76 
 
 		 811 aa  772    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.71 
 
 		 865 aa  727    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  47.71 
 
 		 865 aa  715    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0200  ATPase  47.5 
 
 		 867 aa  734    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  50 
 
 		 830 aa  740    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  48.09 
 
 		 855 aa  720    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5916  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  50.18 
 
 		 942 aa  759    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  47.16 
 
 		 862 aa  721    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  47.54 
 
 		 891 aa  711    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  51.96 
 
 		 823 aa  740    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  45.75 
 
 		 872 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  50.97 
 
 		 814 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  46.71 
 
 		 865 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  45.99 
 
 		 872 aa  713    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  51.27 
 
 		 949 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  47.18 
 
 		 865 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  45.86 
 
 		 862 aa  738    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  50.07 
 
 		 843 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  45.79 
 
 		 862 aa  724    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  49.87 
 
 		 846 aa  727    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  49.7 
 
 		 949 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.64 
 
 		 811 aa  769    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  48.19 
 
 		 842 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  52.51 
 
 		 824 aa  736    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.54 
 
 		 840 aa  763    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.71 
 
 		 865 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.77 
 
 		 834 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  47.24 
 
 		 879 aa  732    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  46.81 
 
 		 870 aa  717    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  47.72 
 
 		 879 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  50.3 
 
 		 949 aa  783    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  48.8 
 
 		 866 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  46.97 
 
 		 961 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  47.07 
 
 		 865 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  46.98 
 
 		 862 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  47.36 
 
 		 879 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  46.68 
 
 		 860 aa  717    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  47.83 
 
 		 865 aa  715    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  46.34 
 
 		 862 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1210  ATPase AAA-2  49.81 
 
 		 861 aa  712    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0522971  normal  0.881937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  47.92 
 
 		 859 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  50.23 
 
 		 946 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  47.54 
 
 		 865 aa  740    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  59.36 
 
 		 837 aa  765    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  60.17 
 
 		 886 aa  909    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  51.63 
 
 		 834 aa  739    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  46.48 
 
 		 891 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.84 
 
 		 814 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  48.7 
 
 		 814 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  52.01 
 
 		 825 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  50.41 
 
 		 825 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  47.87 
 
 		 857 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  47.87 
 
 		 857 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  47.34 
 
 		 864 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  47.94 
 
 		 865 aa  733    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.13 
 
 		 828 aa  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  47.18 
 
 		 865 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  51.8 
 
 		 953 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  52.26 
 
 		 850 aa  799    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  49.42 
 
 		 830 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3818  ATPase  53.41 
 
 		 857 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  47.54 
 
 		 865 aa  740    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  50.23 
 
 		 946 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0263  ATPase  45.36 
 
 		 873 aa  719    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.602009  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  47.87 
 
 		 857 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  51.69 
 
 		 839 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  47.64 
 
 		 864 aa  718    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  46.84 
 
 		 873 aa  744    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4012  ATPase  48.12 
 
 		 953 aa  734    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  50.21 
 
 		 861 aa  710    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  47.69 
 
 		 857 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  48.44 
 
 		 857 aa  710    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  51.17 
 
 		 847 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  46.38 
 
 		 859 aa  726    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  49.48 
 
 		 949 aa  785    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  46.48 
 
 		 865 aa  709    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2225  ATPase  48.02 
 
 		 867 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3198  ATPase  47.85 
 
 		 867 aa  719    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  46.71 
 
 		 865 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  48.28 
 
 		 867 aa  722    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  47.7 
 
 		 870 aa  723    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  48.06 
 
 		 842 aa  715    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  47.99 
 
 		 843 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  48.09 
 
 		 855 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  48.43 
 
 		 859 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  44.39 
 
 		 863 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>