More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  76.01 
 
 		 450 aa  726    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  70.33 
 
 		 453 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  76.01 
 
 		 446 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  70.55 
 
 		 453 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  77.25 
 
 		 446 aa  730    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  70.77 
 
 		 453 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  71.36 
 
 		 445 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  70.51 
 
 		 451 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  71.65 
 
 		 453 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  84.56 
 
 		 447 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  70.11 
 
 		 453 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  76.68 
 
 		 446 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  76.58 
 
 		 446 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  69.84 
 
 		 451 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  70.69 
 
 		 449 aa  672    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  68.13 
 
 		 453 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  67.79 
 
 		 455 aa  643    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 447 aa  924    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  76.58 
 
 		 446 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  76.68 
 
 		 446 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  70.85 
 
 		 446 aa  676    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  76.58 
 
 		 446 aa  723    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  69.27 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  68.53 
 
 		 446 aa  626  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  67.86 
 
 		 445 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  66.67 
 
 		 444 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  67.56 
 
 		 444 aa  617  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  69.13 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  65.86 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  65.64 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  65.55 
 
 		 447 aa  611  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  66.07 
 
 		 446 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  65.92 
 
 		 446 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  65.77 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  62.64 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  62.72 
 
 		 446 aa  579  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  59.96 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  57.92 
 
 		 445 aa  523  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  57.27 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  54.79 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  55.68 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  54.52 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  55.2 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  54.3 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  54.09 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  55.63 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  55.1 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  53.64 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  53.41 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  52.58 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  51.82 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  48.75 
 
 		 450 aa  448  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  52.01 
 
 		 447 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  47.42 
 
 		 443 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  49 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  48.87 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  49.78 
 
 		 444 aa  418  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  47.06 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  49.43 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  47.51 
 
 		 443 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  46.99 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  47.66 
 
 		 444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  47.15 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  47.84 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  46.55 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  45.48 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  47.32 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  47.72 
 
 		 456 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  47.94 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  46.01 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  46.01 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  45.89 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  45.89 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  48.86 
 
 		 449 aa  398  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  46.98 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  44.47 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  46.35 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  45.47 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  44.87 
 
 		 449 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  45.56 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  48.76 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  46.8 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  45.98 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  47.51 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  43.54 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  46.15 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  45.45 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  47.49 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  46.92 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  45.43 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  48.27 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  44.47 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  44.14 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  44.44 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  47.87 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  43.14 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  45.94 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  47.17 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  44.32 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>