21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0423 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0423  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0596  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.01 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1228  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 302 aa  108  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0493  uroporphyrinogen-III synthase  31.9 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  29.95 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1098  uroporphyrinogen-III synthase  32.2 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.236356  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1223  uroporphyrinogen-III synthase  34.08 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.732844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1121  uroporphyrinogen-III synthase  31.58 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.629537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  29.69 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0644  uroporphyrinogen-III synthase  32.97 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1483  uroporphyrinogen-III synthase  28.1 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.217942  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  28.57 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.87 
 
 		 516 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1477  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.14 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0358  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.56 
 
 		 526 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0428  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.56 
 
 		 526 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256746  hitchhiker  0.000733658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.11 
 
 		 527 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0945  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.16 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.86 
 
 		 516 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.7 
 
 		 604 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.25 
 
 		 238 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>