194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0019 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  60.53 
 
 		 189 aa  229  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  54.01 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  53.48 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  52.11 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  52.41 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  54.01 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  50 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  53.48 
 
 		 187 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  49.74 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  52.17 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  48.94 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  45.03 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  46.56 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  47.83 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  41.8 
 
 		 191 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  42.86 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  43.39 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  40.1 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  40.21 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.68 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  35.45 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.09 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  60.87 
 
 		 69 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  61.19 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  58.21 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  62.69 
 
 		 69 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.56 
 
 		 111 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  50 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  52 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  54.79 
 
 		 73 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  54.79 
 
 		 73 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  58.82 
 
 		 69 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  57.97 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  50 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  50.72 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  58.82 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  48.61 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  49.32 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  49.3 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  48.81 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  47.22 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  41.46 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  45.95 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  47.62 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.62 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.62 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  50.7 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  45.88 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.53 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.37 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  44.71 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  44.59 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.44 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1028  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000970664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.86 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  41.46 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.67 
 
 		 113 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  48.57 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.59 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.59 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.58 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  41.98 
 
 		 109 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  58 
 
 		 69 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  44.05 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  43.04 
 
 		 124 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.59 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.25 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.83 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.74 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  47.37 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.53 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.14 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.67 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  44.05 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1476  PhnA protein  47.14 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>