196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0107 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  62.63 
 
 		 189 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  65.95 
 
 		 192 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  65.41 
 
 		 192 aa  247  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  57.07 
 
 		 192 aa  235  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  59.69 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  56.25 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  57.92 
 
 		 189 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  60.22 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  59.68 
 
 		 187 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  54.5 
 
 		 190 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  59.68 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  59.14 
 
 		 187 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  57.89 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  52.66 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  51.58 
 
 		 191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  47.8 
 
 		 191 aa  192  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  49.21 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.68 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  50 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  47.09 
 
 		 188 aa  180  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  42.02 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.4 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  52.78 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  53.73 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  50.7 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.27 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  50 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  56.72 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  50 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  51.52 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  50 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  52.11 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  54.41 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  56.06 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  54.41 
 
 		 101 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  52.11 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  52.94 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  55.22 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.11 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  50.7 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  52.24 
 
 		 101 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  50.75 
 
 		 69 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  47.76 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  49.25 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  55.88 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2838  hypothetical protein  30.21 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  49.4 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  58.49 
 
 		 69 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.59 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.12 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.14 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.29 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  42.68 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  43.84 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.84 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.84 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.24 
 
 		 113 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  45.21 
 
 		 112 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.71 
 
 		 114 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  42.47 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.07 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.21 
 
 		 130 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.07 
 
 		 113 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.05 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0402  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000320565  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  45.59 
 
 		 101 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.86 
 
 		 113 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.86 
 
 		 113 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  49.25 
 
 		 71 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  42.68 
 
 		 112 aa  52.4  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.3 
 
 		 113 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1127  hypothetical protein  29.59 
 
 		 126 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1752  hypothetical protein  30.21 
 
 		 125 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 		 118 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 		 114 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>