192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1382 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  99.47 
 
 
187 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  99.47 
 
 
187 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  98.4 
 
 
187 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  97.33 
 
 
187 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  90.91 
 
 
187 aa  344  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  89.84 
 
 
187 aa  340  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  89.3 
 
 
187 aa  338  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  89.3 
 
 
187 aa  338  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  71.74 
 
 
192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  68.85 
 
 
192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  70.65 
 
 
188 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  62.37 
 
 
189 aa  248  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  60 
 
 
195 aa  224  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  54.26 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  56.02 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  54.01 
 
 
184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  59.14 
 
 
189 aa  194  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  53.16 
 
 
192 aa  191  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  49.74 
 
 
191 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  49.73 
 
 
190 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  50 
 
 
188 aa  181  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  50.57 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
185 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  43.92 
 
 
191 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  46.84 
 
 
192 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  38.92 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  53.03 
 
 
72 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.72 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  51.56 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  53.03 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  51.52 
 
 
72 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.24 
 
 
111 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  51.52 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  49.23 
 
 
69 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  50.77 
 
 
69 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  50.77 
 
 
69 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  48.48 
 
 
72 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  46.97 
 
 
70 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  49.23 
 
 
69 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  51.47 
 
 
73 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  47.69 
 
 
101 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  40.96 
 
 
113 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  50 
 
 
73 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  33.33 
 
 
124 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  51.47 
 
 
73 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  41.46 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.12 
 
 
112 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  41.46 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  45.45 
 
 
101 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  59.57 
 
 
69 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  38.3 
 
 
99 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.37 
 
 
112 aa  57.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  44.62 
 
 
131 aa  57.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.37 
 
 
113 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  44.62 
 
 
101 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.37 
 
 
113 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  49.28 
 
 
71 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.76 
 
 
112 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  39.76 
 
 
112 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.04 
 
 
134 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  44.12 
 
 
101 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  44.05 
 
 
114 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  43.37 
 
 
113 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  42.17 
 
 
111 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  50 
 
 
114 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  48.57 
 
 
73 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
120 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  40.96 
 
 
120 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  40.96 
 
 
120 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.42 
 
 
113 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  44.44 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  44.44 
 
 
112 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.48 
 
 
79 aa  56.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.19 
 
 
114 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  40.96 
 
 
111 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  40.96 
 
 
113 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.46 
 
 
113 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 
112 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.62 
 
 
99 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.03 
 
 
113 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.03 
 
 
113 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>