192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1581 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1581  phnA protein  100 
 
 		 187 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  97.33 
 
 		 187 aa  361  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  97.33 
 
 		 187 aa  361  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  91.44 
 
 		 187 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  91.44 
 
 		 187 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  96.79 
 
 		 187 aa  360  8e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  91.44 
 
 		 187 aa  360  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  91.98 
 
 		 187 aa  359  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  90.91 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  70.65 
 
 		 192 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  68.31 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  69.02 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  60.22 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  58.38 
 
 		 195 aa  221  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  55.85 
 
 		 189 aa  220  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  56.54 
 
 		 192 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  60.75 
 
 		 189 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  53.48 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  52.13 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  50 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  48.15 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  49.48 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  49.43 
 
 		 185 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.85 
 
 		 185 aa  167  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  44.97 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  46.56 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  39.46 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  54.55 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  54.55 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  53.12 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.37 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  53.03 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  53.03 
 
 		 70 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.56 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  46.34 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  46.34 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0216  PhnA domain-containing protein  52.31 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0010  conserved hypothetical protein, PhnA family  50.77 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  46.75 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  46.25 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0195  PhnA domain-containing protein  52.31 
 
 		 69 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0178  PhnA domain-containing protein  50.77 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  48.48 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  50 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  51.47 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  42.17 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  52.94 
 
 		 73 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  43.21 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  52.94 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.19 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.78 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  61.7 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.9 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  46.97 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.78 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  39.36 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  42.35 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  45.59 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  42.17 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  42.17 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.25 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  46.15 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  46.15 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  42.17 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.3 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.3 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.83 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  53.73 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.87 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  45.95 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  51.52 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.58 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.63 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0725  PhnA protein  50 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  41.46 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  45.57 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1254  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 79 aa  57.4  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0192046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.27 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>