176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000186 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000186  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000051475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05820  hypothetical protein  96.76 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0626  PhnA protein  67.55 
 
 		 188 aa  265  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0555496  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0481  phnA protein  63.49 
 
 		 191 aa  247  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000775848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1574  putative phosphonoacetate hydrolase PhnA  48.15 
 
 		 189 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1109  PhnA protein  51.05 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1443  PhnA protein  49.12 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1349  putative PhnA protein  50.29 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2295  PhnA protein-like protein  47.92 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1309  PhnA protein-like  51.15 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.569365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1382  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0107  putative phnA protein  48.68 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2956  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1421  PhnA protein  50.57 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1398  PhnA protein  50.57 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2760  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2861  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2692  PhnA protein  50 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739311 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04990  hypothetical protein  46.35 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2615  PhnA protein-like protein  44.27 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1581  phnA protein  48.28 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1091  PhnA protein  45.41 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.393322 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2128  PhnA protein  41.88 
 
 		 191 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.900407  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0017  PhnA protein  41.94 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4456  PhnA protein-like protein  41.97 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0019  PhnA protein  39.68 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5171  PhnA protein  33.15 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.310533  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6324  PhnA protein  50 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.862401  hitchhiker  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7168  PhnA protein  46.38 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2270  PhnA protein  46.97 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6481  PhnA protein  47.69 
 
 		 101 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.82401  normal  0.811468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1948  PhnA protein  46.97 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.707433  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1104  PhnA protein  46.97 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1993  PhnA protein  46.97 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4323  PhnA protein  44.29 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.784258  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4393  PhnA protein  41.43 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4218  PhnA protein  42.86 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.855897  normal  0.884479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2462  PhnA protein  44.62 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285508  normal  0.369901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4993  PhnA protein  41.54 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1830  PhnA protein  45.45 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0790585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2006  PhnA protein  40 
 
 		 73 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.166263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1812  PhnA protein  40 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689852  hitchhiker  0.00415439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5247  alkylphosphonate uptake protein  40.91 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0585  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.94 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5393  PhnA-like protein  42.42 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.29 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  43.08 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1056  PhnA protein  43.08 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  46.27 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.5 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  36.27 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.19 
 
 		 113 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1710  PhnA protein  41.54 
 
 		 73 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1463  phnA protein, putative  52.08 
 
 		 69 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.258363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6145  PhnA protein  48 
 
 		 69 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1298  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.76 
 
 		 112 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.62 
 
 		 112 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  36.19 
 
 		 113 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  38.1 
 
 		 112 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.54 
 
 		 113 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  36.19 
 
 		 113 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  41.54 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.62 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01751  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 112 aa  51.2  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  30.08 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.8 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.54 
 
 		 112 aa  51.2  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  32.38 
 
 		 113 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.62 
 
 		 112 aa  51.2  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 113 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  43.08 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  43.08 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2844  PhnA protein  41.54 
 
 		 70 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.834334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.58 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2244  hypothetical protein  32.32 
 
 		 96 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.45 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  37.14 
 
 		 113 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0570  hypothetical protein  31.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  39.24 
 
 		 114 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  32.69 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.92 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  30.39 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.94 
 
 		 111 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  31.73 
 
 		 112 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  43.08 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  42.47 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5170  PhnA-like protein  38.46 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00732124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  35.24 
 
 		 113 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  42.47 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  34 
 
 		 113 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  41.54 
 
 		 113 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>