191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2936 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 
111 aa  228  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  85.59 
 
 
111 aa  198  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
118 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 
117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 
117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 
117 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.98 
 
 
112 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.98 
 
 
112 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  53.85 
 
 
118 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
114 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  53.51 
 
 
113 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.78 
 
 
113 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  51.79 
 
 
112 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  51.79 
 
 
112 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.91 
 
 
113 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.91 
 
 
114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  51.75 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.3 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  51.33 
 
 
124 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  50.44 
 
 
113 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.1 
 
 
112 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  52.21 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.1 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  50.89 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  52.21 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.33 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.33 
 
 
112 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
130 aa  106  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.33 
 
 
112 aa  106  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.12 
 
 
113 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.33 
 
 
113 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  49.12 
 
 
114 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  49.12 
 
 
113 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  50.93 
 
 
109 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  48.67 
 
 
113 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.79 
 
 
113 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.67 
 
 
112 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.67 
 
 
113 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.25 
 
 
113 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.09 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.09 
 
 
137 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0322  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.57 
 
 
116 aa  104  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0378499  hitchhiker  0.00000000814869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
113 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
134 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0257  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.01 
 
 
113 aa  103  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3336  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.17 
 
 
114 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
113 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.96 
 
 
137 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
112 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.9 
 
 
112 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
120 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  47.37 
 
 
120 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  47.37 
 
 
120 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  49.09 
 
 
111 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
113 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
113 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.37 
 
 
113 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  48.72 
 
 
114 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.67 
 
 
113 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  46.49 
 
 
122 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
115 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  46.02 
 
 
113 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.54 
 
 
108 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.12 
 
 
113 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.79 
 
 
112 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.56 
 
 
113 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.25 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0160  PhnA protein  49.14 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.542327  hitchhiker  0.0000205972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  46.49 
 
 
113 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.69 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.11 
 
 
112 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>