190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1344 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1344  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.204916  normal  0.319142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3850  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.29 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.678342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0099  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1275  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6556  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0933451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6162  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0784231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0710  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.19 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6554  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.8 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.78 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6268  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.88 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940336  normal  0.486413 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7062  PhnA protein  54.13 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225206  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  57.41 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.63 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  50 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  49.54 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0240  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0482  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.7 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.15 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  49.11 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3342  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  49.11 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  48.62 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0257  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.07 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.07 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3011  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2082  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0286  phnA family protein  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0298  phnA family protein  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3336  putative alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.85 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.55 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  52.78 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.55 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  52.78 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  48.65 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.46 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.38 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.3 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  50 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  47.75 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.37 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.66 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.79 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.3 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  47.66 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.79 
 
 		 113 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.3 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  46.73 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.71 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.53 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  46.79 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  46.79 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1165  alkylphosphonate uptake protein  47.12 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  50.93 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.79 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  49.07 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.07 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.54 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.46 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.72 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.07 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.62 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.11 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.73 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.18 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  48.18 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.18 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  44.44 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2533  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  44.25 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.07 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.85 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.15 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  47.22 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  48.62 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.79 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>