189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1818 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2159  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1818  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  64.6 
 
 		 113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.06 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  61.06 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  58.41 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  62.83 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.71 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.29 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  61.47 
 
 		 111 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.82 
 
 		 113 aa  153  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.75 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  56.64 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  56.64 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.06 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  59.29 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.14 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.04 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.04 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.75 
 
 		 113 aa  151  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.04 
 
 		 110 aa  150  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.82 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.93 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  59.63 
 
 		 111 aa  150  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  60.71 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  60.71 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  60.55 
 
 		 111 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.52 
 
 		 130 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.36 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  58.72 
 
 		 111 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  58.41 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  58.41 
 
 		 113 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.18 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  56.64 
 
 		 113 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  58.41 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.29 
 
 		 113 aa  146  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.56 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.29 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.87 
 
 		 113 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.04 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.25 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.41 
 
 		 113 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  54.46 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.64 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  56.14 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  55.75 
 
 		 113 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  60.55 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.46 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  57.27 
 
 		 109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2533  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.45 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.57 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  54.46 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.46 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.46 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.21 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.46 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.57 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2382  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.14 
 
 		 116 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00334109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.17 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.57 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.57 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.89 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  53.21 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.91 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  51.82 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.21 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  50 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  51.38 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.38 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0340  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.29 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1248  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.15 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1092  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.7 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4936  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.12 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950023  normal  0.423894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1298  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.09 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30650  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.04 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1931  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.64 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00764196  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1233  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.78 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1747  PhnA protein  49.12 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0953769  normal  0.26972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3747  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.25 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>